38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0806 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  100 
 
 		 1107 aa  2256    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0805  hypothetical protein  95.05 
 
 		 202 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  50 
 
 		 3027 aa  65.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  55.38 
 
 		 4009 aa  65.1  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  56.25 
 
 		 1394 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 1188 aa  61.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  55.38 
 
 		 4022 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  53.03 
 
 		 830 aa  60.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  54.41 
 
 		 14609 aa  59.3  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  55.17 
 
 		 1316 aa  58.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  44.44 
 
 		 1831 aa  58.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  39.78 
 
 		 654 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  49.28 
 
 		 767 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  42.22 
 
 		 692 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  47.54 
 
 		 3907 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  31.3 
 
 		 6678 aa  55.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  49.18 
 
 		 3822 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1487 aa  53.5  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  42.68 
 
 		 474 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.62 
 
 		 11716 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  45.9 
 
 		 3861 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0018  hypothetical protein  54.55 
 
 		 1020 aa  52.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3625  hypothetical protein  55.38 
 
 		 442 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  37 
 
 		 496 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  24.71 
 
 		 4357 aa  48.9  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.35 
 
 		 2031 aa  48.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1265 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  29.75 
 
 		 736 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  46.38 
 
 		 866 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1282  calcium-binding protein, putative  56.82 
 
 		 63 aa  47.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  51.92 
 
 		 640 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  44.44 
 
 		 1332 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1916 aa  46.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  46.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 		 1735 aa  45.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1908 aa  45.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 462 aa  45.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.1 
 
 		 3507 aa  44.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>