19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1282 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1282  calcium-binding protein, putative  100 
 
 
63 aa  125  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  54.55 
 
 
4357 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  50 
 
 
4009 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  67.57 
 
 
14609 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  58.54 
 
 
1446 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  56.82 
 
 
1107 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  50 
 
 
4022 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  52.27 
 
 
1394 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  45.61 
 
 
1831 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  50 
 
 
2374 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  42.86 
 
 
3027 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  47.73 
 
 
767 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  47.83 
 
 
1321 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  54.76 
 
 
1188 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  46.3 
 
 
654 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  46.67 
 
 
692 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  51.43 
 
 
3822 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  62.5 
 
 
474 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  47.92 
 
 
830 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>