69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1960 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  100 
 
 		 2374 aa  4826    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1265 aa  103  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0163  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1056 aa  90.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000567499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  55.84 
 
 		 14609 aa  65.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.8 
 
 		 1735 aa  65.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 		 1258 aa  64.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  42.22 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.62 
 
 		 1414 aa  59.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  24.52 
 
 		 1400 aa  59.3  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  47.22 
 
 		 1332 aa  58.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.35 
 
 		 1086 aa  57.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  48.68 
 
 		 462 aa  56.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  23.7 
 
 		 1397 aa  56.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.51 
 
 		 1093 aa  56.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  27.11 
 
 		 692 aa  56.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  23.92 
 
 		 1054 aa  55.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.54 
 
 		 1118 aa  55.5  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.4 
 
 		 1351 aa  54.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.11 
 
 		 1355 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.58 
 
 		 1340 aa  53.5  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  29.57 
 
 		 1378 aa  53.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.91 
 
 		 11716 aa  53.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  26.87 
 
 		 386 aa  53.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  27.85 
 
 		 1366 aa  53.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  43.84 
 
 		 1394 aa  53.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  50 
 
 		 3822 aa  53.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  45.83 
 
 		 3027 aa  52.8  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.44 
 
 		 795 aa  52.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  21.69 
 
 		 1342 aa  52.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 1046 aa  52  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  27.83 
 
 		 1388 aa  52  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.5 
 
 		 1374 aa  51.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  26.24 
 
 		 667 aa  51.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  23.82 
 
 		 1346 aa  51.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  35.71 
 
 		 1151 aa  51.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  48.39 
 
 		 3861 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  22.22 
 
 		 1105 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.15 
 
 		 1355 aa  51.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  25.81 
 
 		 695 aa  50.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  27.49 
 
 		 321 aa  50.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  26.38 
 
 		 359 aa  49.7  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  25.25 
 
 		 1017 aa  49.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.65 
 
 		 306 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  27.2 
 
 		 1378 aa  48.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  22.06 
 
 		 1114 aa  49.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  22.07 
 
 		 1278 aa  48.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23 
 
 		 1485 aa  48.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  35.96 
 
 		 1363 aa  48.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  28.64 
 
 		 2223 aa  48.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1181 aa  48.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  21.52 
 
 		 1374 aa  48.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1107 aa  48.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.35 
 
 		 6678 aa  48.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  23.78 
 
 		 1051 aa  48.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  30.97 
 
 		 1407 aa  47.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  44.3 
 
 		 4009 aa  47  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 		 1158 aa  46.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 1226 aa  47  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  32.09 
 
 		 1362 aa  46.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.57 
 
 		 1070 aa  46.6  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  33.64 
 
 		 1185 aa  46.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 		 1453 aa  46.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.71 
 
 		 1024 aa  46.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  25.8 
 
 		 1179 aa  46.2  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  24.31 
 
 		 283 aa  46.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  23.78 
 
 		 1053 aa  45.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  25.81 
 
 		 1034 aa  45.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  23.79 
 
 		 1374 aa  45.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  44.3 
 
 		 4022 aa  45.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>