62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1621 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  100 
 
 
654 aa  1329    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  40.16 
 
 
644 aa  105  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  34.43 
 
 
613 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  45.24 
 
 
1206 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  34.53 
 
 
1141 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  38 
 
 
1504 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  39.84 
 
 
14944 aa  87.8  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  37.72 
 
 
978 aa  87.8  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  34.71 
 
 
841 aa  84.7  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1960  PA14 domain protein  31.13 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372065  hitchhiker  0.00673603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  42.06 
 
 
1394 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2533  hypothetical protein  48.72 
 
 
81 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 
831 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  33.82 
 
 
904 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  50 
 
 
14609 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  32.61 
 
 
2215 aa  68.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  33.57 
 
 
2252 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  44.66 
 
 
1332 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  33.08 
 
 
918 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 
995 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  33.09 
 
 
578 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  33.08 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  31.54 
 
 
2447 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  34.91 
 
 
1172 aa  60.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  26.83 
 
 
886 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  32.06 
 
 
1314 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.47 
 
 
4465 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2649  fibronectin, type III domain-containing protein  35.16 
 
 
491 aa  58.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0082024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
974 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  50 
 
 
570 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  39.78 
 
 
1107 aa  57.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0543  fibronectin, type III domain-containing protein  36.63 
 
 
169 aa  57.4  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  29.17 
 
 
849 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  39.67 
 
 
1487 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  47.17 
 
 
568 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
462 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  49.06 
 
 
682 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.44 
 
 
889 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  36.62 
 
 
692 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  37.5 
 
 
565 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.78 
 
 
3802 aa  51.2  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  27.12 
 
 
966 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  33.66 
 
 
1293 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  43.84 
 
 
767 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.44 
 
 
1064 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  36.67 
 
 
3027 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2957  hypothetical protein  43.64 
 
 
221 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  25.86 
 
 
1236 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  35.29 
 
 
1382 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  32.93 
 
 
578 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  53.66 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  37.18 
 
 
2117 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  38.89 
 
 
454 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
1188 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.85 
 
 
760 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  32.46 
 
 
3907 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  34.58 
 
 
1321 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.89 
 
 
558 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  33.87 
 
 
286 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  30 
 
 
882 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  45 
 
 
770 aa  44.3  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>