73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3362 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1529    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1023 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  45.2 
 
 		 772 aa  339  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  46.92 
 
 		 454 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  42.31 
 
 		 682 aa  302  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  39.21 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  37 
 
 		 701 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  35 
 
 		 551 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  39.83 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  35.51 
 
 		 570 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  35.66 
 
 		 568 aa  247  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  35.82 
 
 		 565 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  36.32 
 
 		 819 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  39.91 
 
 		 843 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  36.77 
 
 		 473 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  38.13 
 
 		 924 aa  200  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  32.83 
 
 		 999 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  36.91 
 
 		 593 aa  194  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  36.82 
 
 		 421 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  33.49 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  32.33 
 
 		 450 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  35.33 
 
 		 467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  34.1 
 
 		 701 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.09 
 
 		 1063 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.04 
 
 		 1031 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  33.91 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  31.18 
 
 		 425 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  32.75 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.46 
 
 		 425 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  31.1 
 
 		 421 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  31.82 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  31.04 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  31.28 
 
 		 446 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  30.18 
 
 		 427 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 566 aa  90.9  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  35.12 
 
 		 670 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1011 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  27 
 
 		 1406 aa  74.7  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 1332 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.56 
 
 		 834 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  27.88 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  26.47 
 
 		 885 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  35.05 
 
 		 1275 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.1 
 
 		 1362 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  36.54 
 
 		 1601 aa  51.2  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  34.62 
 
 		 1585 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.31 
 
 		 1050 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.48 
 
 		 1414 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.38 
 
 		 984 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  28.03 
 
 		 870 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.82 
 
 		 1152 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  25.34 
 
 		 580 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.86 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  34.31 
 
 		 1217 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  30.68 
 
 		 543 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  26.84 
 
 		 365 aa  48.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.67 
 
 		 12684 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.1 
 
 		 1059 aa  47.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.72 
 
 		 482 aa  47.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.74 
 
 		 1474 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.25 
 
 		 1002 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  27.81 
 
 		 1146 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  33.33 
 
 		 1247 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  29.82 
 
 		 314 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  33.96 
 
 		 317 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  49.06 
 
 		 1394 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  51.25 
 
 		 314 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  27.78 
 
 		 1748 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  52.17 
 
 		 14609 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  31.87 
 
 		 846 aa  44.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  34.62 
 
 		 1053 aa  44.3  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  30.32 
 
 		 554 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  45 
 
 		 654 aa  44.3  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>