72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2819 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  100 
 
 
1394 aa  2572    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  39.63 
 
 
462 aa  249  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  32.35 
 
 
14609 aa  218  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  47.32 
 
 
830 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  37.3 
 
 
692 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  36.02 
 
 
1908 aa  101  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.07 
 
 
2074 aa  96.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  52.47 
 
 
453 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  44.44 
 
 
1831 aa  94.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  47.62 
 
 
1332 aa  92  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  55.43 
 
 
1159 aa  89  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  41.88 
 
 
1316 aa  84  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  42.91 
 
 
2353 aa  82  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  41.67 
 
 
916 aa  80.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.83 
 
 
2117 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  41.46 
 
 
767 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 
1188 aa  76.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  38.55 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  32.98 
 
 
1000 aa  75.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  42.06 
 
 
654 aa  74.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  43.33 
 
 
1487 aa  74.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  39.6 
 
 
3907 aa  73.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  43.13 
 
 
625 aa  70.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  36.99 
 
 
474 aa  67  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  52.11 
 
 
456 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3648  hypothetical protein  33.33 
 
 
1616 aa  66.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  40.4 
 
 
286 aa  66.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  59.56 
 
 
675 aa  65.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  26.7 
 
 
648 aa  64.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  56.25 
 
 
1107 aa  63.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  49.33 
 
 
3027 aa  63.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  35.48 
 
 
671 aa  62.4  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2486  S-antigen family protein  44.33 
 
 
467 aa  62.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.13457  normal  0.608286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  62.86 
 
 
455 aa  62.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.01 
 
 
1987 aa  61.6  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  35.77 
 
 
496 aa  60.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  38.02 
 
 
4009 aa  60.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  54.78 
 
 
605 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  40.97 
 
 
1480 aa  58.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  39.42 
 
 
1321 aa  58.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  44.26 
 
 
428 aa  58.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  36.36 
 
 
682 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  38.02 
 
 
4022 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  35.9 
 
 
476 aa  56.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  41.57 
 
 
830 aa  55.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  42.57 
 
 
778 aa  55.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  25.61 
 
 
407 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  52.94 
 
 
568 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3859  hypothetical protein  48.18 
 
 
182 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  45.33 
 
 
914 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  37.18 
 
 
4357 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  37.76 
 
 
843 aa  52.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35.14 
 
 
1096 aa  52.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  39.2 
 
 
640 aa  52.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  29.65 
 
 
941 aa  50.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  34.33 
 
 
3822 aa  48.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  50 
 
 
570 aa  48.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  39.19 
 
 
1755 aa  48.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  30.06 
 
 
3861 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  61.45 
 
 
793 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3625  hypothetical protein  36 
 
 
442 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000590004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  44.71 
 
 
433 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  37.38 
 
 
130 aa  46.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  53.09 
 
 
356 aa  47  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  49.47 
 
 
846 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  34.45 
 
 
866 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  60 
 
 
1265 aa  46.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  35.04 
 
 
555 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.54 
 
 
1407 aa  45.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.33 
 
 
2313 aa  45.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3764  hypothetical protein  33.95 
 
 
245 aa  45.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  52.31 
 
 
942 aa  45.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>