62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4025 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  100 
 
 		 1480 aa  2983    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  36.61 
 
 		 1362 aa  485  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  41.63 
 
 		 2848 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  39.29 
 
 		 2839 aa  359  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.96 
 
 		 2476 aa  342  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.64 
 
 		 3089 aa  336  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  38.83 
 
 		 1911 aa  335  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.72 
 
 		 3816 aa  332  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.12 
 
 		 3544 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  38.01 
 
 		 2522 aa  326  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  37.07 
 
 		 2715 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.04 
 
 		 3699 aa  318  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  37.04 
 
 		 2503 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.25 
 
 		 3699 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  35.81 
 
 		 2153 aa  315  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  29.52 
 
 		 2670 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  32.29 
 
 		 3278 aa  190  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  43.19 
 
 		 823 aa  158  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  35.26 
 
 		 14609 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.75 
 
 		 2074 aa  94.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  36.99 
 
 		 1394 aa  92.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  45.92 
 
 		 483 aa  77.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.62 
 
 		 3927 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  55.17 
 
 		 972 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.43 
 
 		 2377 aa  69.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  25.82 
 
 		 3474 aa  66.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 1264 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  39.18 
 
 		 682 aa  62.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  52 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  53.06 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  37.43 
 
 		 1987 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  32.69 
 
 		 570 aa  55.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  42.98 
 
 		 852 aa  55.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  50.94 
 
 		 1332 aa  53.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 462 aa  52.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  52.08 
 
 		 593 aa  52.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 374 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  51.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1908 aa  50.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  38.32 
 
 		 968 aa  50.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  52.08 
 
 		 551 aa  50.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 		 386 aa  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  48.94 
 
 		 454 aa  48.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  32.37 
 
 		 386 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 		 1755 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.79 
 
 		 412 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  48.98 
 
 		 843 aa  47.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  56.41 
 
 		 772 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  35.78 
 
 		 5094 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  47.06 
 
 		 654 aa  47  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31.08 
 
 		 1831 aa  46.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  31.53 
 
 		 373 aa  47  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.36 
 
 		 11716 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 322 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  37.1 
 
 		 770 aa  45.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.18 
 
 		 3191 aa  45.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.9 
 
 		 478 aa  45.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 		 623 aa  45.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  36.71 
 
 		 1755 aa  45.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  48 
 
 		 1107 aa  45.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>