33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4084 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 462 aa  912    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  40.22 
 
 		 1394 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  41.63 
 
 		 14609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.89 
 
 		 1831 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 692 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1908 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  44.25 
 
 		 1332 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1316 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  41.6 
 
 		 1188 aa  67.4  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  42.86 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  36.07 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  45.3 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  41.23 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  32.07 
 
 		 3907 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  38.57 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  37.98 
 
 		 4009 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.92 
 
 		 2117 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.23 
 
 		 3027 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1487 aa  53.9  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  42.31 
 
 		 830 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  40.62 
 
 		 866 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  46.38 
 
 		 1107 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  45.83 
 
 		 843 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  36.43 
 
 		 4022 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  46.05 
 
 		 2374 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  48.33 
 
 		 682 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  32.65 
 
 		 3861 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.16 
 
 		 3822 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2490  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  34.93 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  39.19 
 
 		 1755 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3764  hypothetical protein  51.06 
 
 		 245 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  43.33 
 
 		 1265 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>