33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1119 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  917    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  42.08 
 
 
14609 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  39.74 
 
 
692 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  40 
 
 
1394 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  54.63 
 
 
640 aa  113  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  41.77 
 
 
1831 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1243  hypothetical protein  32.64 
 
 
339 aa  96.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  39.44 
 
 
1316 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  40.29 
 
 
1188 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  43.75 
 
 
830 aa  73.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  47.1 
 
 
1487 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  56.82 
 
 
767 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  36.36 
 
 
4009 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  46.39 
 
 
474 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  42 
 
 
3822 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35.76 
 
 
4022 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1107  hypothetical protein  31.62 
 
 
694 aa  60.1  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  34.03 
 
 
3907 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  42.42 
 
 
3861 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  40.17 
 
 
3027 aa  57  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  33.98 
 
 
1908 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  37.74 
 
 
527 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  49.35 
 
 
866 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  48.05 
 
 
1107 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.76 
 
 
4357 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  50 
 
 
2031 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
496 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3362  hypothetical protein  33.62 
 
 
365 aa  47  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  36.7 
 
 
2117 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  44.34 
 
 
1332 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  36.8 
 
 
2374 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  33.04 
 
 
286 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>