19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1243 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1243  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  666    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 
476 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1107  hypothetical protein  30.13 
 
 
694 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  35.05 
 
 
1107 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  41.89 
 
 
1265 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  35.79 
 
 
3027 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  48.15 
 
 
14609 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.62 
 
 
2281 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  39.73 
 
 
1394 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  56.41 
 
 
1908 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  43.66 
 
 
4009 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  31.54 
 
 
2374 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  58.82 
 
 
1188 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  63.41 
 
 
1316 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  44.59 
 
 
3861 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  51.02 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  45.07 
 
 
4022 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2490  hypothetical protein  54.29 
 
 
188 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  32.18 
 
 
1831 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>