59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0642 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 2281 aa  4442    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.25 
 
 		 1800 aa  90.1  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1829 aa  75.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.51 
 
 		 1012 aa  67  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1822 aa  65.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.74 
 
 		 2194 aa  64.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 994 aa  63.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 850 aa  63.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.07 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  37.72 
 
 		 2305 aa  62  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.03 
 
 		 891 aa  60.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1315 aa  60.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.38 
 
 		 3602 aa  60.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1980 aa  60.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.21 
 
 		 1118 aa  60.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.26 
 
 		 1113 aa  60.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.4 
 
 		 1222 aa  60.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 		 889 aa  60.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.48 
 
 		 1340 aa  59.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  26.47 
 
 		 2153 aa  58.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  32.98 
 
 		 892 aa  58.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.05 
 
 		 761 aa  58.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  27.6 
 
 		 715 aa  58.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.83 
 
 		 1225 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.43 
 
 		 3474 aa  57  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.72 
 
 		 2310 aa  56.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1107  hypothetical protein  50 
 
 		 694 aa  56.2  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.34 
 
 		 2074 aa  55.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  38.32 
 
 		 511 aa  55.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.41 
 
 		 1009 aa  54.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  37.5 
 
 		 644 aa  54.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  36.59 
 
 		 755 aa  53.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1750 aa  52.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.89 
 
 		 1415 aa  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.36 
 
 		 2542 aa  52  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  29.29 
 
 		 982 aa  52.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1512 aa  50.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.67 
 
 		 1037 aa  50.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  34.78 
 
 		 3394 aa  49.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.22 
 
 		 2522 aa  50.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.97 
 
 		 1661 aa  49.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.19 
 
 		 3699 aa  49.3  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1416 aa  49.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.96 
 
 		 721 aa  48.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.11 
 
 		 3544 aa  48.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.19 
 
 		 2503 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1781 aa  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.46 
 
 		 1597 aa  47.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  42.25 
 
 		 4978 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4069  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.61 
 
 		 490 aa  47.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  29.84 
 
 		 1089 aa  47.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  51.56 
 
 		 780 aa  47.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.53 
 
 		 1867 aa  47  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 		 3699 aa  47  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 		 768 aa  46.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  54.05 
 
 		 852 aa  46.2  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30 
 
 		 2476 aa  46.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.85 
 
 		 2839 aa  46.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  29.41 
 
 		 1716 aa  45.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>