57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2032 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  100 
 
 		 1908 aa  3870    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  45.95 
 
 		 1316 aa  204  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  45.43 
 
 		 1487 aa  175  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2034  hypothetical protein  89.01 
 
 		 103 aa  161  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.56 
 
 		 1188 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  34.76 
 
 		 1394 aa  126  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31 
 
 		 1831 aa  110  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  33.96 
 
 		 14609 aa  106  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  41.86 
 
 		 1100 aa  92.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3425  hypothetical protein  30.81 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  47.29 
 
 		 767 aa  85.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.69 
 
 		 2074 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2285  hypothetical protein  30.95 
 
 		 486 aa  81.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 692 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  37.6 
 
 		 1446 aa  73.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 1264 aa  72  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.83 
 
 		 1407 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 462 aa  71.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  33.87 
 
 		 474 aa  70.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  44.35 
 
 		 1332 aa  70.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  31.52 
 
 		 1755 aa  68.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  51.47 
 
 		 3027 aa  68.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  30.11 
 
 		 8918 aa  67  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  44.04 
 
 		 866 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  42.57 
 
 		 1387 aa  63.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1987 aa  61.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.46 
 
 		 4357 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  47.14 
 
 		 1107 aa  60.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.55 
 
 		 2117 aa  57.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0034  hypothetical protein  40.54 
 
 		 106 aa  55.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  35.75 
 
 		 3861 aa  54.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  36.28 
 
 		 3907 aa  53.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.06 
 
 		 4022 aa  52.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  44.74 
 
 		 286 aa  52.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  34.83 
 
 		 830 aa  52.4  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  36.84 
 
 		 4009 aa  51.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  37.5 
 
 		 654 aa  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0742  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.54 
 
 		 1355 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  69.44 
 
 		 2848 aa  50.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  50 
 
 		 640 aa  50.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 496 aa  48.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  37.93 
 
 		 483 aa  48.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  50.82 
 
 		 3822 aa  48.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.26 
 
 		 447 aa  48.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.5 
 
 		 420 aa  48.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.77 
 
 		 722 aa  47.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  54.05 
 
 		 3699 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.76 
 
 		 3816 aa  48.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.05 
 
 		 3699 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  56.76 
 
 		 3544 aa  48.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  54.05 
 
 		 2503 aa  47.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  54.05 
 
 		 2522 aa  47.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.49 
 
 		 2031 aa  46.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 322 aa  46.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  37.29 
 
 		 780 aa  45.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  71.43 
 
 		 2153 aa  45.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 374 aa  45.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>