More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0342 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  100 
 
 		 447 aa  896    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  45.79 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  46.1 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  82.69 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  58.52 
 
 		 319 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 457 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.86 
 
 		 468 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.13 
 
 		 454 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 466 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 401 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  35.8 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  53.73 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  35.5 
 
 		 459 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  54.55 
 
 		 294 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  32.96 
 
 		 381 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.64 
 
 		 478 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.35 
 
 		 402 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  56.38 
 
 		 344 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  40.56 
 
 		 322 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  56.38 
 
 		 344 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  56.38 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  56.38 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  56.38 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  56.38 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  55.7 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.67 
 
 		 487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  40.82 
 
 		 314 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  53.69 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  54.79 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  53.69 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  62.07 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  36.74 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  53.29 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  33.4 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  55.26 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.26 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  50.58 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.67 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  51.85 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.42 
 
 		 542 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.97 
 
 		 623 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.41 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.23 
 
 		 1987 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 		 1755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  53.1 
 
 		 209 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  52.03 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  55.47 
 
 		 335 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  43.8 
 
 		 727 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.11 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.15 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  50.34 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  51.39 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  40 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  32.22 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  47.03 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  40.21 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  44.37 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  47.48 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.31 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  56.52 
 
 		 333 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  46.36 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  54.87 
 
 		 210 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  45.41 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  52.59 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  45.03 
 
 		 266 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.56 
 
 		 637 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  53.04 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.38 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 		 1264 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  58.62 
 
 		 1707 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  48.31 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  47.92 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  47.92 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  47.33 
 
 		 362 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.61 
 
 		 240 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  49.54 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  36.63 
 
 		 367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  50.44 
 
 		 314 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  37.64 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  37.64 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  41.83 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  44.67 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  54.72 
 
 		 443 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.01 
 
 		 244 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  36.18 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.44 
 
 		 506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  41.38 
 
 		 201 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  43.45 
 
 		 202 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  52.34 
 
 		 212 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  42.36 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>