More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5254 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 1264 aa  2434    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1987 aa  452  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  50.67 
 
 		 1755 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.97 
 
 		 623 aa  363  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  36.41 
 
 		 570 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  29.22 
 
 		 1793 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  29.07 
 
 		 637 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.8 
 
 		 374 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.48 
 
 		 542 aa  154  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.68 
 
 		 478 aa  153  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 543 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 		 498 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 544 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.67 
 
 		 490 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.55 
 
 		 458 aa  147  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 456 aa  147  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 440 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.33 
 
 		 447 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.83 
 
 		 2074 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.47 
 
 		 320 aa  139  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.17 
 
 		 319 aa  139  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  41.96 
 
 		 420 aa  134  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.71 
 
 		 429 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.47 
 
 		 294 aa  132  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 510 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.99 
 
 		 506 aa  129  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.84 
 
 		 402 aa  127  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  44.81 
 
 		 386 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35.32 
 
 		 487 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 727 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 386 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.03 
 
 		 427 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.28 
 
 		 412 aa  124  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.27 
 
 		 417 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 428 aa  102  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 		 440 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  35.08 
 
 		 540 aa  99  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  98.6  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  30.76 
 
 		 8918 aa  94.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 360 aa  91.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 		 193 aa  88.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  35.27 
 
 		 342 aa  88.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  31.98 
 
 		 322 aa  88.2  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  33.13 
 
 		 445 aa  88.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 380 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 704 aa  85.5  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 189 aa  85.5  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 658 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.77 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 314 aa  82.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.11 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  35.89 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  35 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.1 
 
 		 620 aa  82.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.44 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.44 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.27 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.13 
 
 		 352 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.24 
 
 		 345 aa  80.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 671 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  26.49 
 
 		 505 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  35.14 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.91 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.11 
 
 		 344 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.11 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 271 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  30.22 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.11 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 226 aa  79.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.02 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  30.86 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.45 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  52.63 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.53 
 
 		 1313 aa  78.2  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  34.13 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.11 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  47.3 
 
 		 361 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 375 aa  77.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  39.47 
 
 		 348 aa  77.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.33 
 
 		 209 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.79 
 
 		 344 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 215 aa  77.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 		 673 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 270 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  47.41 
 
 		 780 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 416 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  43.31 
 
 		 269 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 364 aa  77.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.71 
 
 		 375 aa  77.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  42.99 
 
 		 658 aa  77  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 375 aa  77  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 525 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  36.91 
 
 		 403 aa  76.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>