172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2796 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  40.25 
 
 		 2522 aa  746    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  40.36 
 
 		 1911 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  39.83 
 
 		 3089 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  40.13 
 
 		 3544 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  39.4 
 
 		 3699 aa  745    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  40.11 
 
 		 2503 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  40.85 
 
 		 2476 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.28 
 
 		 3816 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.78 
 
 		 3699 aa  745    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 2153 aa  4160    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.03 
 
 		 2839 aa  613  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  37.8 
 
 		 2715 aa  600  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  34.02 
 
 		 2670 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.81 
 
 		 1480 aa  321  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.13 
 
 		 3477 aa  311  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  32.77 
 
 		 2848 aa  280  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.17 
 
 		 994 aa  278  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 850 aa  273  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  32.49 
 
 		 1362 aa  231  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  43.82 
 
 		 2074 aa  228  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.16 
 
 		 892 aa  188  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.07 
 
 		 761 aa  186  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.14 
 
 		 3927 aa  173  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.34 
 
 		 3278 aa  171  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  40.88 
 
 		 3474 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.91 
 
 		 2507 aa  165  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 		 4978 aa  164  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.74 
 
 		 1884 aa  153  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  46.78 
 
 		 715 aa  152  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.71 
 
 		 1597 aa  145  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  32.12 
 
 		 1367 aa  145  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.75 
 
 		 5745 aa  141  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.82 
 
 		 3191 aa  141  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.64 
 
 		 2377 aa  141  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  39.93 
 
 		 2132 aa  138  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 369 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  43 
 
 		 2001 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1512 aa  133  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  39.3 
 
 		 1750 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.16 
 
 		 2816 aa  130  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.71 
 
 		 1363 aa  123  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  33.23 
 
 		 1269 aa  113  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 1867 aa  109  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.81 
 
 		 2767 aa  108  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  32.47 
 
 		 1269 aa  105  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  31.7 
 
 		 1268 aa  105  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.56 
 
 		 2114 aa  100  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.14 
 
 		 3363 aa  98.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.45 
 
 		 721 aa  97.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1416 aa  97.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  41.67 
 
 		 814 aa  97.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  30.18 
 
 		 4854 aa  96.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  33.11 
 
 		 2233 aa  94.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.55 
 
 		 4848 aa  92  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1066 aa  92  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  23.08 
 
 		 9867 aa  89  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.55 
 
 		 16322 aa  89  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.15 
 
 		 4220 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  32.21 
 
 		 994 aa  86.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  30.29 
 
 		 2353 aa  85.9  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.28 
 
 		 2807 aa  84.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  36.17 
 
 		 1502 aa  84.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31 
 
 		 2555 aa  82.4  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.7 
 
 		 1706 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  32.11 
 
 		 1215 aa  82  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  32.11 
 
 		 1215 aa  82  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  30.37 
 
 		 663 aa  80.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.83 
 
 		 1109 aa  79.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 1712 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.64 
 
 		 1779 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  36.84 
 
 		 8321 aa  74.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  25.14 
 
 		 2056 aa  74.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.63 
 
 		 1215 aa  73.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.63 
 
 		 1215 aa  73.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  31.16 
 
 		 1422 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.67 
 
 		 747 aa  72.8  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1744 aa  72.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  32.16 
 
 		 2011 aa  72  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.14 
 
 		 1215 aa  72  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.86 
 
 		 3396 aa  71.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.19 
 
 		 4122 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  30.48 
 
 		 991 aa  70.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  31.12 
 
 		 2039 aa  70.1  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 1410 aa  69.3  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 1410 aa  69.3  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 1408 aa  68.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  47.37 
 
 		 2924 aa  68.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  30.99 
 
 		 2040 aa  67.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  27.49 
 
 		 2027 aa  68.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1061 aa  67.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.69 
 
 		 1283 aa  66.6  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.39 
 
 		 4798 aa  66.2  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  25.53 
 
 		 7284 aa  65.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.25 
 
 		 1286 aa  65.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  36.79 
 
 		 511 aa  63.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.27 
 
 		 2542 aa  63.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  31.7 
 
 		 1141 aa  62.4  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  39.81 
 
 		 974 aa  62.4  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  26.32 
 
 		 2636 aa  62  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  42.17 
 
 		 755 aa  61.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>