106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0933 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 2636 aa  4975    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  39.23 
 
 		 1779 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  48.53 
 
 		 1830 aa  280  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  32.83 
 
 		 3244 aa  205  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  31.4 
 
 		 2079 aa  203  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.68 
 
 		 3699 aa  197  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.47 
 
 		 3544 aa  195  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.89 
 
 		 3699 aa  195  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  36.19 
 
 		 2042 aa  140  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  37.33 
 
 		 1275 aa  137  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.3 
 
 		 2522 aa  133  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  38.92 
 
 		 1439 aa  119  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.65 
 
 		 2402 aa  106  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  39.67 
 
 		 731 aa  101  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  28.53 
 
 		 2233 aa  97.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30.35 
 
 		 2476 aa  97.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.34 
 
 		 2853 aa  96.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.07 
 
 		 2839 aa  95.5  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  44.87 
 
 		 1804 aa  94.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 		 2507 aa  93.2  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  54.01 
 
 		 2042 aa  92.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.88 
 
 		 2503 aa  90.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  29.59 
 
 		 1672 aa  86.3  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.27 
 
 		 3563 aa  83.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  29.53 
 
 		 2820 aa  83.6  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 		 11716 aa  80.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  29.51 
 
 		 1631 aa  80.5  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  54.02 
 
 		 1869 aa  76.3  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.81 
 
 		 2656 aa  75.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  29.34 
 
 		 3927 aa  75.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.06 
 
 		 1092 aa  73.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1879 aa  72.8  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  67.57 
 
 		 2802 aa  72  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.67 
 
 		 1597 aa  71.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.02 
 
 		 3474 aa  69.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.41 
 
 		 4465 aa  68.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 		 4231 aa  67.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.22 
 
 		 2744 aa  65.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  30.11 
 
 		 2001 aa  64.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.35 
 
 		 1884 aa  63.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  33.7 
 
 		 5020 aa  63.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  30.77 
 
 		 800 aa  63.2  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.52 
 
 		 887 aa  63.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  26.92 
 
 		 2153 aa  62.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.82 
 
 		 850 aa  62  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  36 
 
 		 4022 aa  62.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 2831 aa  62.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  36.52 
 
 		 797 aa  61.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.09 
 
 		 1526 aa  60.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.6 
 
 		 994 aa  60.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.97 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  27.27 
 
 		 2890 aa  59.3  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30 
 
 		 3598 aa  58.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.13 
 
 		 1673 aa  58.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.18 
 
 		 2377 aa  58.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  34.38 
 
 		 1238 aa  58.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.18 
 
 		 8321 aa  57  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  25.99 
 
 		 2334 aa  55.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  38.03 
 
 		 657 aa  55.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  38.03 
 
 		 657 aa  55.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  26.03 
 
 		 3089 aa  55.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  39.36 
 
 		 2239 aa  55.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  27.47 
 
 		 393 aa  54.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2961 aa  55.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  34.68 
 
 		 4009 aa  55.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.36 
 
 		 4978 aa  55.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3592  hypothetical protein  39.33 
 
 		 743 aa  54.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  24.55 
 
 		 1232 aa  54.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  29.64 
 
 		 1532 aa  53.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1585 aa  53.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3547  hypothetical protein  41.11 
 
 		 607 aa  52.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.93 
 
 		 3911 aa  52.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1002 aa  52.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.3 
 
 		 2542 aa  52.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  38.89 
 
 		 1126 aa  51.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  26.55 
 
 		 892 aa  52  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  29.32 
 
 		 683 aa  51.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  32.59 
 
 		 1222 aa  51.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  25.87 
 
 		 2027 aa  51.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  25.53 
 
 		 4798 aa  51.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  38.14 
 
 		 2192 aa  50.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.99 
 
 		 1269 aa  50.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.49 
 
 		 1152 aa  50.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  27.76 
 
 		 1421 aa  50.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.93 
 
 		 2074 aa  50.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  24.8 
 
 		 2039 aa  49.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.1 
 
 		 7284 aa  49.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0451  Ig-like, group 2  41.57 
 
 		 770 aa  49.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  23.97 
 
 		 2715 aa  49.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.97 
 
 		 1867 aa  49.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  25.86 
 
 		 3920 aa  49.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0859  hypothetical protein  22.72 
 
 		 668 aa  49.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.197444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.78 
 
 		 1146 aa  48.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  28.1 
 
 		 1911 aa  48.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  41 
 
 		 475 aa  47.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.03 
 
 		 4855 aa  47.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.25 
 
 		 1268 aa  47.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.91 
 
 		 5745 aa  47.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  34.36 
 
 		 1148 aa  47.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.06 
 
 		 815 aa  47.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>