More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0379 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0379  VCBS  100 
 
 
7284 aa  13900    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.44 
 
 
1884 aa  272  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.34 
 
 
4220 aa  234  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.53 
 
 
2507 aa  199  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.59 
 
 
1597 aa  194  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.62 
 
 
5745 aa  191  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.26 
 
 
4978 aa  190  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  45.08 
 
 
3927 aa  182  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.47 
 
 
3474 aa  179  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.59 
 
 
3191 aa  176  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 
2074 aa  169  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  30.51 
 
 
4854 aa  155  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  31.74 
 
 
892 aa  155  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.64 
 
 
1269 aa  155  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  39.08 
 
 
1586 aa  154  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.74 
 
 
1867 aa  150  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.94 
 
 
3619 aa  147  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.38 
 
 
3608 aa  145  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  30.59 
 
 
2567 aa  145  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.86 
 
 
3619 aa  145  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  38.18 
 
 
7149 aa  144  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.13 
 
 
1269 aa  143  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.28 
 
 
9867 aa  143  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.54 
 
 
1268 aa  143  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.72 
 
 
4848 aa  142  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  34.6 
 
 
5094 aa  142  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  31.96 
 
 
2345 aa  141  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.12 
 
 
1706 aa  141  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  51.28 
 
 
6678 aa  140  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  31.53 
 
 
912 aa  137  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.02 
 
 
994 aa  137  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.01 
 
 
8321 aa  133  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.2 
 
 
2839 aa  132  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  29.3 
 
 
3182 aa  131  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26 
 
 
16311 aa  130  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  28.56 
 
 
2127 aa  128  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.12 
 
 
3544 aa  124  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.22 
 
 
5020 aa  124  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.77 
 
 
369 aa  122  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 
1553 aa  120  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  28.66 
 
 
2924 aa  119  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  30.96 
 
 
1631 aa  118  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.32 
 
 
3699 aa  118  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 
2555 aa  116  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.41 
 
 
1855 aa  116  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  29.69 
 
 
1883 aa  115  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.11 
 
 
820 aa  114  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.45 
 
 
946 aa  114  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  27.31 
 
 
4661 aa  112  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.08 
 
 
3954 aa  112  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.73 
 
 
3699 aa  112  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.61 
 
 
1141 aa  112  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.54 
 
 
850 aa  110  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 
4334 aa  109  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.18 
 
 
4836 aa  107  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.59 
 
 
3209 aa  106  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.46 
 
 
2767 aa  106  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.65 
 
 
2522 aa  105  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.02 
 
 
3363 aa  105  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  35.5 
 
 
1206 aa  104  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  30.17 
 
 
768 aa  102  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.67 
 
 
2114 aa  102  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.13 
 
 
2816 aa  102  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.46 
 
 
1534 aa  101  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.48 
 
 
3259 aa  99.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  50.81 
 
 
1764 aa  99  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.89 
 
 
4285 aa  98.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  31.28 
 
 
2467 aa  98.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.81 
 
 
2807 aa  98.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.3 
 
 
1599 aa  97.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 
1428 aa  97.4  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.07 
 
 
4798 aa  96.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  41.95 
 
 
2198 aa  95.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.69 
 
 
3816 aa  95.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  38.14 
 
 
2133 aa  95.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.82 
 
 
814 aa  95.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  29.07 
 
 
6211 aa  94.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  32.17 
 
 
3026 aa  94.4  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  47.89 
 
 
1019 aa  93.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.07 
 
 
1795 aa  93.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.82 
 
 
14916 aa  94  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.75 
 
 
1079 aa  92.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  34.92 
 
 
2060 aa  93.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  33.42 
 
 
1532 aa  92.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.21 
 
 
2812 aa  92.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.67 
 
 
1363 aa  92.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.49 
 
 
2377 aa  92.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  25.81 
 
 
3758 aa  91.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.57 
 
 
1279 aa  91.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.59 
 
 
1499 aa  90.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.62 
 
 
3089 aa  90.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  34.46 
 
 
3714 aa  90.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  31.89 
 
 
2024 aa  89  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 
907 aa  89  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  31.11 
 
 
1421 aa  88.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50 
 
 
2667 aa  88.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  29.53 
 
 
938 aa  88.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  25.13 
 
 
1512 aa  88.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.1 
 
 
2353 aa  88.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.57 
 
 
959 aa  87.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>