156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0115 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  60.94 
 
 		 1422 aa  1621    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  95.25 
 
 		 1408 aa  2609    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  100 
 
 		 1410 aa  2796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  100 
 
 		 1410 aa  2796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  53.69 
 
 		 1107 aa  312  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  50 
 
 		 1108 aa  310  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  32.21 
 
 		 576 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  31.52 
 
 		 533 aa  180  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  32.37 
 
 		 576 aa  179  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  31.64 
 
 		 576 aa  178  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  32.2 
 
 		 524 aa  173  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  32.78 
 
 		 526 aa  170  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  31.27 
 
 		 480 aa  146  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.43 
 
 		 1597 aa  146  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  34.01 
 
 		 826 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  35.74 
 
 		 478 aa  136  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  36.17 
 
 		 478 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  29.9 
 
 		 478 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  30.47 
 
 		 501 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  36.75 
 
 		 480 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  37.18 
 
 		 480 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  37.02 
 
 		 480 aa  133  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  37.18 
 
 		 480 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  35.19 
 
 		 480 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.84 
 
 		 1222 aa  129  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.15 
 
 		 1884 aa  122  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.54 
 
 		 4978 aa  122  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.5 
 
 		 994 aa  119  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  25.64 
 
 		 1367 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  25.98 
 
 		 1363 aa  105  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  29.28 
 
 		 3927 aa  105  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.71 
 
 		 850 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.37 
 
 		 921 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.14 
 
 		 721 aa  97.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.99 
 
 		 1269 aa  94.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.49 
 
 		 5745 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.95 
 
 		 2377 aa  92  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2308  hypothetical protein  28.25 
 
 		 962 aa  92  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.21 
 
 		 2114 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.9 
 
 		 2074 aa  90.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.74 
 
 		 892 aa  89.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.3 
 
 		 2555 aa  89.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.65 
 
 		 761 aa  86.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27.74 
 
 		 1268 aa  85.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.09 
 
 		 624 aa  83.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  29.59 
 
 		 3474 aa  83.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.22 
 
 		 3544 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  30 
 
 		 778 aa  81.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.8 
 
 		 717 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  35.11 
 
 		 1911 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  35.64 
 
 		 3089 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  28.92 
 
 		 1129 aa  81.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.03 
 
 		 2522 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  26.11 
 
 		 628 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  35.6 
 
 		 2476 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.39 
 
 		 3699 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.16 
 
 		 1215 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  27.87 
 
 		 1215 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.16 
 
 		 1215 aa  79.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  35.45 
 
 		 2503 aa  78.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  26.78 
 
 		 2816 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.39 
 
 		 1215 aa  77  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  29.31 
 
 		 1215 aa  77  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.65 
 
 		 4848 aa  77.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 3816 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.75 
 
 		 8321 aa  76.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  29.38 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.39 
 
 		 3699 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  27.62 
 
 		 1269 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  25.33 
 
 		 618 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.3 
 
 		 2767 aa  70.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.68 
 
 		 818 aa  70.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.62 
 
 		 2507 aa  70.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.55 
 
 		 1066 aa  70.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.94 
 
 		 2839 aa  70.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  31.51 
 
 		 2153 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  25 
 
 		 821 aa  69.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  29.84 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  33.83 
 
 		 663 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.12 
 
 		 714 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  27.95 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.69 
 
 		 3191 aa  65.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  29.96 
 
 		 307 aa  64.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1512 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  29.7 
 
 		 792 aa  65.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  26.62 
 
 		 743 aa  63.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  29 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.69 
 
 		 3477 aa  63.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.23 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  28.22 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24.92 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.63 
 
 		 1679 aa  62  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  23.11 
 
 		 807 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  34.21 
 
 		 1502 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.16 
 
 		 4220 aa  60.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.93 
 
 		 2145 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  24.05 
 
 		 2084 aa  60.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 16322 aa  58.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  25.38 
 
 		 461 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  24.31 
 
 		 2056 aa  58.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>