More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3623 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  100 
 
 		 5745 aa  10920    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  39.85 
 
 		 3927 aa  1340    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.2 
 
 		 4848 aa  891    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.37 
 
 		 4836 aa  1093    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.87 
 
 		 2816 aa  735    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  40.92 
 
 		 3191 aa  942    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.7 
 
 		 4122 aa  792    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  58.71 
 
 		 4978 aa  3801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.04 
 
 		 9867 aa  745    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.03 
 
 		 1884 aa  646    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.7 
 
 		 4220 aa  891    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.92 
 
 		 2377 aa  498  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  42.39 
 
 		 1268 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  41.84 
 
 		 1269 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  41.46 
 
 		 1269 aa  462  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.2 
 
 		 3363 aa  426  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  46.77 
 
 		 1597 aa  421  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.48 
 
 		 8321 aa  395  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  35.56 
 
 		 2074 aa  379  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.99 
 
 		 3474 aa  362  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  28.03 
 
 		 5094 aa  352  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.24 
 
 		 2812 aa  352  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 16322 aa  331  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.75 
 
 		 1867 aa  329  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 2555 aa  318  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.84 
 
 		 3439 aa  315  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.81 
 
 		 2114 aa  306  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.44 
 
 		 2839 aa  300  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  34.2 
 
 		 1706 aa  270  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  33.57 
 
 		 1367 aa  265  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.98 
 
 		 5020 aa  258  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.79 
 
 		 3182 aa  251  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  24.73 
 
 		 16311 aa  248  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  38.35 
 
 		 892 aa  246  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.49 
 
 		 3714 aa  245  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.69 
 
 		 721 aa  241  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  32.99 
 
 		 2767 aa  234  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.2 
 
 		 3816 aa  233  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  37.15 
 
 		 3477 aa  226  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  32.36 
 
 		 1363 aa  221  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.04 
 
 		 3699 aa  214  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.61 
 
 		 3699 aa  213  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.71 
 
 		 994 aa  210  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.57 
 
 		 5839 aa  208  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.27 
 
 		 3508 aa  208  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.55 
 
 		 5442 aa  208  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  35.4 
 
 		 4791 aa  201  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.94 
 
 		 5787 aa  201  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.9 
 
 		 4854 aa  199  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  38.23 
 
 		 1512 aa  199  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.48 
 
 		 2807 aa  192  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.28 
 
 		 850 aa  187  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  42.01 
 
 		 3324 aa  184  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.17 
 
 		 7284 aa  181  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.5 
 
 		 4285 aa  179  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34.17 
 
 		 2768 aa  177  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  32.15 
 
 		 1428 aa  176  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  26.86 
 
 		 2524 aa  174  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.95 
 
 		 2507 aa  174  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  26.24 
 
 		 2567 aa  173  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1416 aa  170  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.15 
 
 		 3544 aa  169  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  26.93 
 
 		 2487 aa  168  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  29.79 
 
 		 1141 aa  166  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.03 
 
 		 7149 aa  166  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  37.31 
 
 		 814 aa  164  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  27.53 
 
 		 2027 aa  162  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  40.14 
 
 		 6779 aa  154  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  39.79 
 
 		 6662 aa  152  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.79 
 
 		 6683 aa  152  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.43 
 
 		 1599 aa  149  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  23.7 
 
 		 3758 aa  148  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  28.09 
 
 		 2084 aa  146  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  26.57 
 
 		 2056 aa  145  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.19 
 
 		 761 aa  142  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  34.75 
 
 		 2153 aa  140  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  27.61 
 
 		 2051 aa  140  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.09 
 
 		 711 aa  139  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  35.98 
 
 		 2353 aa  134  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.26 
 
 		 1109 aa  130  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  26.26 
 
 		 1712 aa  130  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.44 
 
 		 369 aa  128  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.82 
 
 		 4106 aa  124  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  25.72 
 
 		 2887 aa  122  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  26.84 
 
 		 2039 aa  120  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  27.39 
 
 		 3089 aa  119  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.22 
 
 		 4798 aa  117  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1806 aa  117  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1744 aa  114  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.07 
 
 		 2853 aa  111  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  29.13 
 
 		 2820 aa  110  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  29.06 
 
 		 2602 aa  109  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  25.7 
 
 		 2067 aa  107  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  34.74 
 
 		 570 aa  107  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  32.7 
 
 		 1215 aa  106  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1750 aa  107  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  28.9 
 
 		 5769 aa  105  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.7 
 
 		 1215 aa  106  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  27.92 
 
 		 2334 aa  105  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  32.38 
 
 		 1215 aa  105  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>