281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4603 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1867 aa  3642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  41.67 
 
 		 3927 aa  586  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.46 
 
 		 2377 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.16 
 
 		 1884 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.36 
 
 		 5787 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.87 
 
 		 4978 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.01 
 
 		 5745 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.08 
 
 		 2074 aa  315  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  27.96 
 
 		 2887 aa  306  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.35 
 
 		 3191 aa  283  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.67 
 
 		 1597 aa  274  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.08 
 
 		 4848 aa  268  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.02 
 
 		 2839 aa  258  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.5 
 
 		 4854 aa  251  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34 
 
 		 1269 aa  243  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  38.17 
 
 		 1598 aa  233  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.82 
 
 		 3474 aa  231  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.45 
 
 		 994 aa  227  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  32.38 
 
 		 1268 aa  226  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  28.53 
 
 		 4285 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2767 aa  218  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.38 
 
 		 2812 aa  211  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 		 2507 aa  205  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.48 
 
 		 1269 aa  204  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.92 
 
 		 892 aa  201  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.72 
 
 		 16322 aa  201  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.9 
 
 		 1706 aa  196  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.97 
 
 		 4220 aa  192  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  38.42 
 
 		 2825 aa  189  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  31.53 
 
 		 5009 aa  187  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.88 
 
 		 3363 aa  185  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.22 
 
 		 2555 aa  185  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  32.49 
 
 		 1232 aa  181  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.41 
 
 		 850 aa  177  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 6006 aa  175  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  32.87 
 
 		 7284 aa  173  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 4836 aa  171  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.62 
 
 		 4122 aa  164  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 1599 aa  164  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  30.15 
 
 		 1631 aa  162  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  34.69 
 
 		 2816 aa  159  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  25.85 
 
 		 3544 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.23 
 
 		 2114 aa  158  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  32.53 
 
 		 721 aa  158  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.29 
 
 		 5020 aa  157  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  29.89 
 
 		 2127 aa  152  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.63 
 
 		 8321 aa  151  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1512 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  29.19 
 
 		 2820 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.65 
 
 		 3699 aa  150  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  35.93 
 
 		 2251 aa  149  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 		 1141 aa  147  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.65 
 
 		 3699 aa  147  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  29.17 
 
 		 2853 aa  145  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.19 
 
 		 814 aa  144  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.52 
 
 		 3477 aa  144  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  31.04 
 
 		 2478 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  28.34 
 
 		 3391 aa  141  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1067 aa  140  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1949 aa  140  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  28 
 
 		 5094 aa  138  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  28.75 
 
 		 1367 aa  137  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.11 
 
 		 2239 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.84 
 
 		 3089 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.51 
 
 		 3816 aa  133  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.37 
 
 		 369 aa  132  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  25.89 
 
 		 3439 aa  132  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  26.47 
 
 		 2193 aa  130  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.32 
 
 		 761 aa  129  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.31 
 
 		 2153 aa  129  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  29.5 
 
 		 1363 aa  123  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.29 
 
 		 777 aa  120  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  29.38 
 
 		 3244 aa  118  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 3259 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.94 
 
 		 1428 aa  118  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  35.97 
 
 		 567 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 3038 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.56 
 
 		 3182 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.69 
 
 		 3758 aa  117  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.75 
 
 		 4661 aa  116  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.47 
 
 		 16311 aa  116  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1056 aa  116  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.18 
 
 		 1779 aa  115  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  22.47 
 
 		 9867 aa  112  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  38.91 
 
 		 7149 aa  111  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  25.6 
 
 		 2567 aa  111  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.63 
 
 		 2784 aa  110  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.39 
 
 		 802 aa  110  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  28.04 
 
 		 2079 aa  108  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 		 3396 aa  107  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.27 
 
 		 1063 aa  107  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.12 
 
 		 4798 aa  106  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  42.05 
 
 		 715 aa  106  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.72 
 
 		 1109 aa  105  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  37.02 
 
 		 1416 aa  105  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.39 
 
 		 4465 aa  105  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  32.78 
 
 		 666 aa  104  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.16 
 
 		 2807 aa  103  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  57 
 
 		 2542 aa  102  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.8 
 
 		 11716 aa  102  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>