271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4137 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  80.46 
 
 		 3182 aa  1446    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1599 aa  3076    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  44.48 
 
 		 3229 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  39.63 
 
 		 3259 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.18 
 
 		 1553 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.51 
 
 		 2067 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.76 
 
 		 4122 aa  370  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  32.37 
 
 		 4285 aa  266  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 		 4836 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  31.8 
 
 		 4661 aa  211  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.96 
 
 		 5839 aa  194  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  32.35 
 
 		 2887 aa  183  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  36.92 
 
 		 16311 aa  182  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.59 
 
 		 2555 aa  182  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.06 
 
 		 2812 aa  181  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.21 
 
 		 2239 aa  180  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  39.93 
 
 		 6678 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  50.22 
 
 		 6662 aa  176  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.22 
 
 		 6683 aa  176  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  50.22 
 
 		 6779 aa  176  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.51 
 
 		 1883 aa  174  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.96 
 
 		 1706 aa  172  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  48.5 
 
 		 2768 aa  169  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.28 
 
 		 5787 aa  164  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.58 
 
 		 3714 aa  159  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.49 
 
 		 3191 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  38.93 
 
 		 16322 aa  154  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  62.12 
 
 		 5442 aa  151  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  28.06 
 
 		 2524 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.69 
 
 		 4220 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.02 
 
 		 1597 aa  149  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.43 
 
 		 5745 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.83 
 
 		 2784 aa  149  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  57.14 
 
 		 4791 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 		 3508 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  49.39 
 
 		 7149 aa  143  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.17 
 
 		 4978 aa  142  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29 
 
 		 4854 aa  137  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.94 
 
 		 1884 aa  137  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.82 
 
 		 1867 aa  131  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.37 
 
 		 2251 aa  129  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.73 
 
 		 5020 aa  129  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  30.94 
 
 		 2743 aa  128  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.31 
 
 		 8871 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  47.06 
 
 		 5444 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.9 
 
 		 2812 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.9 
 
 		 3474 aa  123  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  28.32 
 
 		 2127 aa  123  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  26.54 
 
 		 2567 aa  121  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.34 
 
 		 3927 aa  117  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  30.13 
 
 		 5094 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  32.05 
 
 		 1206 aa  110  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.46 
 
 		 3758 aa  108  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.85 
 
 		 14916 aa  107  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  32.74 
 
 		 3477 aa  107  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.06 
 
 		 2839 aa  104  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.76 
 
 		 3816 aa  103  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.36 
 
 		 5098 aa  102  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  27.52 
 
 		 1141 aa  102  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  55.43 
 
 		 4848 aa  99.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1350 aa  97.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1806 aa  96.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  40.23 
 
 		 4214 aa  93.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.22 
 
 		 2816 aa  90.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  26.57 
 
 		 7284 aa  90.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.78 
 
 		 3026 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.72 
 
 		 3038 aa  83.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.18 
 
 		 3439 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27.45 
 
 		 1269 aa  78.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.68 
 
 		 2337 aa  77.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  37.72 
 
 		 8321 aa  77  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  24.55 
 
 		 2767 aa  77  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.2 
 
 		 1428 aa  75.5  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 5171 aa  75.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  28.04 
 
 		 510 aa  73.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  35.5 
 
 		 542 aa  71.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  33.79 
 
 		 2127 aa  71.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  28.89 
 
 		 2461 aa  70.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1699 aa  70.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  28.94 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  25.59 
 
 		 1269 aa  68.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1109 aa  68.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 		 1728 aa  67.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.82 
 
 		 994 aa  68.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  26.33 
 
 		 4748 aa  67.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  35.22 
 
 		 8682 aa  66.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  26.03 
 
 		 1268 aa  66.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  35 
 
 		 9030 aa  66.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.58 
 
 		 3396 aa  65.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  30.96 
 
 		 237 aa  64.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 2074 aa  63.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  34.63 
 
 		 235 aa  63.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.12 
 
 		 850 aa  63.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  26.73 
 
 		 3544 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  25.35 
 
 		 3699 aa  63.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 		 1073 aa  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  34.38 
 
 		 6753 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.57 
 
 		 5962 aa  62.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  28.42 
 
 		 892 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.74 
 
 		 2807 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>