106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1239 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1239  VCBS  100 
 
 		 2461 aa  4799    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.18 
 
 		 8871 aa  312  4e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  36.15 
 
 		 3259 aa  261  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.68 
 
 		 16311 aa  221  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  32.8 
 
 		 4661 aa  212  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  31.73 
 
 		 3229 aa  204  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  28.02 
 
 		 2567 aa  184  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  58.55 
 
 		 2133 aa  182  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  53.21 
 
 		 3954 aa  171  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.99 
 
 		 6678 aa  170  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  52 
 
 		 1838 aa  167  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.36 
 
 		 2067 aa  165  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  53.29 
 
 		 4334 aa  155  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  51.97 
 
 		 1855 aa  153  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.86 
 
 		 1553 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 		 8980 aa  133  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  47.92 
 
 		 2132 aa  132  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  45.45 
 
 		 3391 aa  130  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  47.3 
 
 		 2820 aa  131  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.9 
 
 		 1019 aa  129  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  40.12 
 
 		 2853 aa  128  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  39.05 
 
 		 4465 aa  127  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  40 
 
 		 3132 aa  126  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  44.83 
 
 		 3714 aa  123  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  49.4 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.86 
 
 		 3439 aa  120  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.12 
 
 		 2239 aa  120  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  29.63 
 
 		 4285 aa  118  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  45.71 
 
 		 2001 aa  117  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  46.1 
 
 		 12741 aa  117  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  25.85 
 
 		 2024 aa  116  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  26.74 
 
 		 4379 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  40.54 
 
 		 3508 aa  114  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 824 aa  113  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 		 3363 aa  112  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  28.18 
 
 		 2127 aa  112  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.74 
 
 		 14916 aa  110  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  26.62 
 
 		 1883 aa  110  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  34.86 
 
 		 426 aa  109  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.47 
 
 		 4854 aa  109  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  40.82 
 
 		 922 aa  108  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  40 
 
 		 940 aa  106  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  39.62 
 
 		 3066 aa  106  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.27 
 
 		 5020 aa  106  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1933 aa  105  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  40 
 
 		 938 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.67 
 
 		 3427 aa  104  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  38.1 
 
 		 337 aa  103  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  30.5 
 
 		 1206 aa  101  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 9867 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1025 aa  97.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  42.97 
 
 		 3193 aa  97.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  24.76 
 
 		 2784 aa  97.1  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.18 
 
 		 1963 aa  96.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.93 
 
 		 3089 aa  93.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  40 
 
 		 2807 aa  92.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.41 
 
 		 2812 aa  92.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  27.61 
 
 		 2039 aa  92  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  35.67 
 
 		 1022 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  35.67 
 
 		 1017 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  36.81 
 
 		 3182 aa  89.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.54 
 
 		 5094 aa  89.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1013 aa  88.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.65 
 
 		 2743 aa  87.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.57 
 
 		 813 aa  85.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  34.55 
 
 		 917 aa  84  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  33.33 
 
 		 2802 aa  84  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  29.35 
 
 		 1557 aa  82  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.57 
 
 		 1055 aa  79.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.6 
 
 		 3026 aa  78.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  30.56 
 
 		 3758 aa  75.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  30.65 
 
 		 2060 aa  74.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  27.27 
 
 		 2337 aa  75.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1126 aa  73.6  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  30.56 
 
 		 4120 aa  73.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  31.02 
 
 		 991 aa  72  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.29 
 
 		 8321 aa  71.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.54 
 
 		 2678 aa  71.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 		 1599 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.82 
 
 		 1884 aa  70.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.11 
 
 		 11716 aa  69.3  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  27.5 
 
 		 1728 aa  68.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  24.16 
 
 		 3091 aa  67  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  35.92 
 
 		 1143 aa  64.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  31.05 
 
 		 998 aa  64.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.06 
 
 		 3927 aa  63.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.75 
 
 		 1597 aa  62.8  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  25.83 
 
 		 3834 aa  59.3  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.44 
 
 		 2555 aa  58.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 		 2507 aa  58.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  28.47 
 
 		 2145 aa  56.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.12 
 
 		 2887 aa  55.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  26.58 
 
 		 1141 aa  55.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.09 
 
 		 1706 aa  54.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  29.67 
 
 		 7284 aa  53.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.06 
 
 		 4978 aa  52.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  40.24 
 
 		 1323 aa  52.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14743  predicted protein  25.13 
 
 		 1900 aa  50.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.97 
 
 		 850 aa  49.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  27.87 
 
 		 2524 aa  48.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>