231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0478 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  41.75 
 
 		 3229 aa  1359    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.09 
 
 		 2067 aa  789    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  34.04 
 
 		 4661 aa  728    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.52 
 
 		 8871 aa  720    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 3259 aa  6254    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  38.58 
 
 		 4285 aa  899    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.05 
 
 		 1553 aa  771    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.55 
 
 		 1599 aa  569  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  52.54 
 
 		 3182 aa  552  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.01 
 
 		 16311 aa  538  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  31.72 
 
 		 2567 aa  540  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 		 3439 aa  498  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.46 
 
 		 4854 aa  493  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.9 
 
 		 6678 aa  486  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  32.67 
 
 		 3132 aa  476  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.24 
 
 		 5020 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.5 
 
 		 2784 aa  359  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.48 
 
 		 1883 aa  342  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.7 
 
 		 2812 aa  336  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  39.63 
 
 		 5444 aa  305  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.79 
 
 		 5839 aa  299  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  27.14 
 
 		 8321 aa  290  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.19 
 
 		 2239 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  36.15 
 
 		 2461 aa  254  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  28.94 
 
 		 2743 aa  232  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  28.88 
 
 		 1206 aa  228  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.65 
 
 		 7149 aa  226  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.18 
 
 		 1963 aa  221  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  31.95 
 
 		 2127 aa  216  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.08 
 
 		 6683 aa  215  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  46.08 
 
 		 6662 aa  215  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.03 
 
 		 3714 aa  211  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 		 6779 aa  204  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.45 
 
 		 5218 aa  202  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.99 
 
 		 4836 aa  199  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  41.79 
 
 		 6753 aa  196  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  41.07 
 
 		 8682 aa  196  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.74 
 
 		 5962 aa  196  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  41.07 
 
 		 9030 aa  196  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  25.29 
 
 		 3758 aa  190  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.19 
 
 		 5787 aa  189  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  27.89 
 
 		 2887 aa  186  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  35.92 
 
 		 4678 aa  166  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.5 
 
 		 4122 aa  161  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  26.1 
 
 		 3508 aa  159  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  28.52 
 
 		 3184 aa  156  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.6 
 
 		 4848 aa  153  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  27.62 
 
 		 2524 aa  146  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 		 3091 aa  139  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  26.96 
 
 		 2127 aa  129  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.5 
 
 		 2542 aa  119  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.62 
 
 		 14916 aa  117  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.76 
 
 		 2768 aa  113  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  27.72 
 
 		 5094 aa  110  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  42.28 
 
 		 16322 aa  108  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 		 4220 aa  107  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.4 
 
 		 2555 aa  105  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 		 686 aa  103  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.38 
 
 		 4978 aa  103  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  39.88 
 
 		 4214 aa  101  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.53 
 
 		 5442 aa  100  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 		 5098 aa  100  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  29.56 
 
 		 4791 aa  99.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 2812 aa  98.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.83 
 
 		 1884 aa  97.8  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.94 
 
 		 3026 aa  94  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.74 
 
 		 11716 aa  93.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 		 1141 aa  93.2  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.48 
 
 		 2039 aa  91.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.27 
 
 		 2507 aa  90.5  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  25.34 
 
 		 3391 aa  83.2  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  23.15 
 
 		 3699 aa  83.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.71 
 
 		 3038 aa  81.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  29.65 
 
 		 7284 aa  81.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  33.46 
 
 		 7919 aa  78.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  24.47 
 
 		 4465 aa  78.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  22.84 
 
 		 6211 aa  77.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  24.08 
 
 		 5745 aa  75.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  30.09 
 
 		 5171 aa  74.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 1598 aa  73.6  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  31.49 
 
 		 2060 aa  72.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  29.74 
 
 		 2337 aa  72  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  36.84 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.17 
 
 		 3699 aa  69.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  23.13 
 
 		 5123 aa  68.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  29.27 
 
 		 4748 aa  68.6  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  36.71 
 
 		 1706 aa  66.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1699 aa  66.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.77 
 
 		 1597 aa  64.7  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  31.17 
 
 		 1867 aa  64.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.88 
 
 		 3191 aa  63.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 		 1073 aa  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 7233 aa  63.9  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.68 
 
 		 3396 aa  63.2  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.76 
 
 		 1838 aa  62.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 946 aa  61.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  29.88 
 
 		 5769 aa  61.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.32 
 
 		 2678 aa  61.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  30.71 
 
 		 686 aa  60.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1350 aa  60.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>