243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1560 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1560  VCBS  100 
 
 		 1838 aa  3641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  35.47 
 
 		 1557 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  52.38 
 
 		 2807 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  44.6 
 
 		 2024 aa  335  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  31.63 
 
 		 4379 aa  314  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.3 
 
 		 1019 aa  282  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.67 
 
 		 1118 aa  282  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.22 
 
 		 1340 aa  278  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.22 
 
 		 1222 aa  275  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  39.63 
 
 		 1013 aa  273  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.71 
 
 		 1113 aa  271  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.45 
 
 		 2194 aa  265  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  78.76 
 
 		 492 aa  260  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.6 
 
 		 1225 aa  256  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.31 
 
 		 889 aa  249  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1933 aa  229  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.74 
 
 		 828 aa  208  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  38.46 
 
 		 872 aa  201  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.43 
 
 		 1012 aa  195  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.52 
 
 		 891 aa  194  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  36.98 
 
 		 1025 aa  189  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  36.76 
 
 		 412 aa  183  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  37.76 
 
 		 662 aa  179  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  37.16 
 
 		 386 aa  178  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.44 
 
 		 1009 aa  173  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  39.29 
 
 		 1126 aa  166  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  53.7 
 
 		 2461 aa  165  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  34.49 
 
 		 554 aa  163  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  37.14 
 
 		 1490 aa  164  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  67.19 
 
 		 6678 aa  163  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1289 aa  159  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.43 
 
 		 644 aa  158  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  47.25 
 
 		 16311 aa  157  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  47.59 
 
 		 8871 aa  155  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.49 
 
 		 813 aa  155  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  44.74 
 
 		 3132 aa  154  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  34.55 
 
 		 604 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  49.08 
 
 		 1855 aa  145  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  41.81 
 
 		 2133 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.4 
 
 		 4334 aa  138  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.7 
 
 		 3954 aa  135  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.53 
 
 		 616 aa  134  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  43.71 
 
 		 2853 aa  133  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  41.86 
 
 		 12741 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 8980 aa  131  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.71 
 
 		 940 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  39.26 
 
 		 2820 aa  127  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  45.22 
 
 		 938 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  47.89 
 
 		 1126 aa  125  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  56.15 
 
 		 2567 aa  124  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  41.14 
 
 		 3508 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  34.34 
 
 		 1275 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  44.9 
 
 		 2132 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  42.95 
 
 		 3066 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  43.54 
 
 		 3391 aa  122  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  41.78 
 
 		 337 aa  118  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  40 
 
 		 2001 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.48 
 
 		 14916 aa  117  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  39.74 
 
 		 4465 aa  117  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  36.08 
 
 		 974 aa  116  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.08 
 
 		 3363 aa  115  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.61 
 
 		 3427 aa  114  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  50.41 
 
 		 3193 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  34.68 
 
 		 426 aa  110  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.65 
 
 		 3089 aa  110  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  33.44 
 
 		 663 aa  110  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  39.47 
 
 		 922 aa  108  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  33.33 
 
 		 2802 aa  108  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  36.63 
 
 		 3714 aa  107  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.34 
 
 		 1372 aa  106  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  29.01 
 
 		 485 aa  103  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  39.46 
 
 		 2796 aa  102  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 		 9867 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.14 
 
 		 472 aa  97.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.79 
 
 		 4661 aa  96.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.97 
 
 		 657 aa  95.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.41 
 
 		 824 aa  94.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  94.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  42 
 
 		 1206 aa  94.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 3977 aa  93.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.33 
 
 		 1052 aa  93.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  51.52 
 
 		 751 aa  93.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  32.88 
 
 		 494 aa  93.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  33.51 
 
 		 917 aa  92.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  46.46 
 
 		 4697 aa  92.4  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.47 
 
 		 685 aa  92.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 837 aa  92  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  40 
 
 		 692 aa  88.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.33 
 
 		 1124 aa  87  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  31.84 
 
 		 1017 aa  87  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  31.84 
 
 		 1022 aa  86.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.42 
 
 		 3197 aa  85.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  31.36 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.92 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.52 
 
 		 3197 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1127 aa  83.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  28.22 
 
 		 435 aa  80.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  32.41 
 
 		 1022 aa  81.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.93 
 
 		 737 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.31 
 
 		 2839 aa  78.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>