103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2386 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 657 aa  1221    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  34.32 
 
 		 616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.43 
 
 		 1019 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.81 
 
 		 1009 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  32.01 
 
 		 685 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.78 
 
 		 891 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.8 
 
 		 1222 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.59 
 
 		 2194 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  32.56 
 
 		 604 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  31.37 
 
 		 1275 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.99 
 
 		 2807 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  31.83 
 
 		 1490 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.7 
 
 		 1838 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.2 
 
 		 1225 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  34.03 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.15 
 
 		 1126 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  35.49 
 
 		 386 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.67 
 
 		 1113 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  35.87 
 
 		 662 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.29 
 
 		 1340 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  34.85 
 
 		 412 aa  97.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.82 
 
 		 1118 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.13 
 
 		 889 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.12 
 
 		 872 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.58 
 
 		 828 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  29.03 
 
 		 644 aa  91.3  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1289 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  31.93 
 
 		 720 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.97 
 
 		 1124 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.86 
 
 		 1012 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.69 
 
 		 974 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.7 
 
 		 1557 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  28.87 
 
 		 494 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.41 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  24.91 
 
 		 4379 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.89 
 
 		 3197 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  30.03 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  27.42 
 
 		 813 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.33 
 
 		 3197 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  40.62 
 
 		 1736 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.32 
 
 		 447 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.84 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  32.62 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.16 
 
 		 1212 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 2082 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.05 
 
 		 1527 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.82 
 
 		 1073 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  31.11 
 
 		 1022 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.22 
 
 		 1109 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 607 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.98 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  30.36 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 		 895 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2117 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.69 
 
 		 803 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  21.72 
 
 		 456 aa  54.3  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.94 
 
 		 772 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 404 aa  53.9  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1638 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1127 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.53 
 
 		 726 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  25.5 
 
 		 438 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.8 
 
 		 1236 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.72 
 
 		 1226 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  32.05 
 
 		 586 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  37.96 
 
 		 608 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.14 
 
 		 959 aa  50.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.2 
 
 		 1246 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.64 
 
 		 1001 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  41.18 
 
 		 1029 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1193 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1575 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  25.53 
 
 		 917 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.12 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  28.09 
 
 		 2002 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 635 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  27.03 
 
 		 829 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  34.15 
 
 		 595 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3385  FG-GAP repeat-containing protein  23.15 
 
 		 463 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 588 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 11716 aa  47.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30 
 
 		 1208 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  25.39 
 
 		 883 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  33.04 
 
 		 1428 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 		 621 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.99 
 
 		 690 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  28.7 
 
 		 1109 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 		 1127 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  31.09 
 
 		 1303 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.63 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  28.21 
 
 		 466 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 1282 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.01 
 
 		 649 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.8 
 
 		 593 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  37.96 
 
 		 161 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  36.05 
 
 		 2886 aa  44.3  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.76 
 
 		 1114 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 		 620 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  23.55 
 
 		 655 aa  43.9  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>