91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0620 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 412 aa  791    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.33 
 
 		 1019 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  44.61 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.72 
 
 		 1222 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.12 
 
 		 2194 aa  219  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.88 
 
 		 1009 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.89 
 
 		 1340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.12 
 
 		 1225 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.41 
 
 		 1118 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.12 
 
 		 891 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.53 
 
 		 889 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.12 
 
 		 1113 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.92 
 
 		 1012 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.15 
 
 		 1838 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.32 
 
 		 2807 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  35.8 
 
 		 644 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.92 
 
 		 872 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.44 
 
 		 1557 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.25 
 
 		 828 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.79 
 
 		 813 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  30.64 
 
 		 554 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  35.18 
 
 		 1275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  35.86 
 
 		 1126 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.86 
 
 		 4379 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  39.94 
 
 		 662 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.28 
 
 		 1490 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1289 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  31.9 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.31 
 
 		 616 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.47 
 
 		 974 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  33.43 
 
 		 604 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.45 
 
 		 685 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.41 
 
 		 485 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.01 
 
 		 494 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  36.73 
 
 		 3197 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  30.29 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  35.94 
 
 		 3197 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  35.15 
 
 		 837 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  29.87 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  30 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  28.89 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  34.89 
 
 		 663 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.36 
 
 		 1124 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.51 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  34.51 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.62 
 
 		 11716 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.97 
 
 		 959 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  31.22 
 
 		 524 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  34.26 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.69 
 
 		 1527 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  32.35 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1127 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1638 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.69 
 
 		 794 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  26.84 
 
 		 521 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  25.64 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.07 
 
 		 569 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.32 
 
 		 1225 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.53 
 
 		 1226 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  24.83 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3385  FG-GAP repeat-containing protein  24.76 
 
 		 463 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1210 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.29 
 
 		 1236 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  24.4 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  24.22 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.11 
 
 		 600 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.4 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  29.55 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  27.33 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.98 
 
 		 1192 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1575 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  27.27 
 
 		 1308 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.75 
 
 		 1088 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  28.74 
 
 		 1161 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  28.41 
 
 		 1022 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  33.04 
 
 		 1126 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  30.46 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  23.87 
 
 		 649 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  35.29 
 
 		 110 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.77 
 
 		 1208 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  28.4 
 
 		 1098 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  34.48 
 
 		 720 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 2558 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.45 
 
 		 1170 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3626  FG-GAP repeat-containing protein  24.78 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2553  hypothetical protein  34.03 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.57 
 
 		 604 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.76 
 
 		 1127 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>