154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0666 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 891 aa  1770    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.1 
 
 		 1009 aa  849    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.06 
 
 		 1222 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.42 
 
 		 1118 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.06 
 
 		 1113 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.29 
 
 		 1225 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.43 
 
 		 1340 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.53 
 
 		 889 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.8 
 
 		 1012 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.87 
 
 		 2194 aa  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  44.13 
 
 		 1019 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.33 
 
 		 928 aa  208  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  47.98 
 
 		 1037 aa  204  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  38.51 
 
 		 412 aa  195  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  39.52 
 
 		 1838 aa  194  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.95 
 
 		 828 aa  194  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  43.35 
 
 		 2305 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.36 
 
 		 2807 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  38.64 
 
 		 386 aa  187  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  42.24 
 
 		 2310 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  35.06 
 
 		 872 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  34.21 
 
 		 1490 aa  155  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.08 
 
 		 813 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.55 
 
 		 768 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  36.36 
 
 		 1126 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  30.41 
 
 		 644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.12 
 
 		 1557 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  38.86 
 
 		 554 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.44 
 
 		 1661 aa  138  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.98 
 
 		 1800 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.32 
 
 		 4379 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  35.02 
 
 		 1275 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  35.71 
 
 		 604 aa  125  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.58 
 
 		 1269 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.34 
 
 		 974 aa  121  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.06 
 
 		 1269 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  31.34 
 
 		 494 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.9 
 
 		 1029 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.64 
 
 		 616 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.38 
 
 		 1180 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  31.72 
 
 		 1029 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1289 aa  104  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  34.51 
 
 		 1124 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.41 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  30.32 
 
 		 5899 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  29.8 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  29.72 
 
 		 485 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  29.27 
 
 		 472 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.17 
 
 		 3168 aa  94.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.53 
 
 		 469 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.66 
 
 		 3197 aa  89.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  29.58 
 
 		 685 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  33 
 
 		 3197 aa  87.8  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  43.4 
 
 		 863 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.31 
 
 		 1415 aa  86.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.62 
 
 		 3396 aa  85.1  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1058 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.95 
 
 		 255 aa  84  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.79 
 
 		 7149 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  32.09 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  36.42 
 
 		 5444 aa  82  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.74 
 
 		 663 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  43.1 
 
 		 1594 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  43.1 
 
 		 1156 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  40.87 
 
 		 2632 aa  77.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  32.84 
 
 		 837 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1127 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.71 
 
 		 2796 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  35.34 
 
 		 715 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.59 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 		 894 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  36.17 
 
 		 2334 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  39.8 
 
 		 161 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.2 
 
 		 8871 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  42.86 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  31.78 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.65 
 
 		 16311 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.38 
 
 		 4013 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  32 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  27.45 
 
 		 2127 aa  64.7  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  36.61 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 		 1091 aa  62.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.58 
 
 		 917 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  31.36 
 
 		 2062 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1638 aa  61.2  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.03 
 
 		 2281 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.98 
 
 		 615 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.19 
 
 		 1092 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.78 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  48.08 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.38 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.47 
 
 		 11716 aa  58.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  32.19 
 
 		 590 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  45.07 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.51 
 
 		 399 aa  56.6  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  27.41 
 
 		 456 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  31.54 
 
 		 524 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.35 
 
 		 469 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  31.4 
 
 		 167 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>