67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3078 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 469 aa  955    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  57.75 
 
 		 487 aa  488  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  34.29 
 
 		 380 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  32.08 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.31 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  32.28 
 
 		 323 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  31.31 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  31.12 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  31.12 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  31.12 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  30.06 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  28.69 
 
 		 419 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  30.42 
 
 		 870 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  33.33 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  29.97 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  30.55 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  28.8 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  30.94 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  29.01 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  31.65 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  29.93 
 
 		 359 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  29.12 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  27.43 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  30.88 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  30.68 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  30 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  28.8 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  26.86 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  27.45 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  30.69 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  27.24 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.1 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  30.41 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  26.8 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  24.5 
 
 		 497 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  25 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.71 
 
 		 891 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  24.32 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.6 
 
 		 3168 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  25.68 
 
 		 655 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 		 1209 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 		 1009 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  33.91 
 
 		 16311 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  25.73 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  27.05 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.81 
 
 		 911 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  24.26 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  28.43 
 
 		 1031 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  35.16 
 
 		 631 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  36.78 
 
 		 7149 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.7 
 
 		 2194 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.91 
 
 		 1012 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  34.41 
 
 		 5444 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.29 
 
 		 646 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.43 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.64 
 
 		 2305 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.86 
 
 		 1222 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.58 
 
 		 1118 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 1225 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 1340 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.94 
 
 		 1113 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.98 
 
 		 1800 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  37.74 
 
 		 1029 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.9 
 
 		 889 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  29.36 
 
 		 2310 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>