58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6330 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  100 
 
 		 326 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  43.16 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  43.15 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  42.21 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.41 
 
 		 422 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  41.88 
 
 		 870 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  39.58 
 
 		 456 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  36.64 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.58 
 
 		 437 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 		 495 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  39.32 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  38.83 
 
 		 393 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.22 
 
 		 448 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  38.36 
 
 		 459 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  36.43 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  38.52 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  38.52 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  38.52 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  35.79 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  38.97 
 
 		 465 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  36.36 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.63 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  38.28 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  34.63 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.9 
 
 		 469 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  35.4 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.91 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  33.44 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  30.87 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  30.83 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  31.18 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  32.28 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  29.63 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.06 
 
 		 469 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  33.88 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  27.89 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  31.99 
 
 		 393 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  41.1 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  32.35 
 
 		 450 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  30.09 
 
 		 497 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.08 
 
 		 646 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.33 
 
 		 588 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  25.27 
 
 		 655 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  25.98 
 
 		 611 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  26.28 
 
 		 596 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.83 
 
 		 639 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.18 
 
 		 452 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 1209 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  26 
 
 		 590 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  25.68 
 
 		 605 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  24.83 
 
 		 628 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  25.18 
 
 		 767 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  23.93 
 
 		 572 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 620 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  23.8 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.79 
 
 		 633 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>