58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0234 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  100 
 
 		 422 aa  825    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  46.02 
 
 		 870 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  52.83 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  50.77 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  49.01 
 
 		 341 aa  242  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  47.4 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.23 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.38 
 
 		 491 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  49.83 
 
 		 330 aa  236  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.14 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  49.66 
 
 		 329 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  49.66 
 
 		 329 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  49.66 
 
 		 329 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  54.89 
 
 		 495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  44.73 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  44.56 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  39.4 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  43.89 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  46.18 
 
 		 359 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  47.6 
 
 		 487 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  40.83 
 
 		 456 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  34.97 
 
 		 469 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  41.13 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  39.8 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.15 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  43.49 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  41.54 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  42.23 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  44.44 
 
 		 501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  40.36 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  39.59 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  34.59 
 
 		 487 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.76 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  31.29 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  46.89 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  32.07 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  32.32 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  30.7 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  30.82 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  28.34 
 
 		 655 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 1128 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  28.05 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.68 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  25.07 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  26.23 
 
 		 767 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.77 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  25.46 
 
 		 596 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.23 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.23 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  26.3 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  25.42 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  24.92 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 1209 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  24.38 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  23.48 
 
 		 791 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>