247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6407 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  100 
 
 		 448 aa  893    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  62.9 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  63.48 
 
 		 465 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  60.05 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  61.76 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  55.16 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  51.89 
 
 		 487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  44.03 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.86 
 
 		 491 aa  189  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  41.11 
 
 		 330 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  41.05 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.96 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  39.37 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  43.01 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  43.01 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  43.01 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.48 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  39.86 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.89 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  41.55 
 
 		 495 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  38.13 
 
 		 326 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  33.87 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.24 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  50.3 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  32.41 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  63.81 
 
 		 847 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  34.43 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  35.38 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  34.64 
 
 		 870 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  34.25 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  62.5 
 
 		 978 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  53.4 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  29.97 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  55.88 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  29.69 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  37.04 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  30.1 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48 
 
 		 846 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  30.74 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  30.11 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  54.08 
 
 		 593 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  50.55 
 
 		 360 aa  99.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.35 
 
 		 609 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  52.38 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  48.96 
 
 		 773 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.28 
 
 		 499 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.84 
 
 		 925 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.23 
 
 		 486 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  50 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  50.59 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  41.1 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.08 
 
 		 812 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  50.48 
 
 		 673 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  50.52 
 
 		 658 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  46.81 
 
 		 488 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.31 
 
 		 681 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.01 
 
 		 455 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  49.12 
 
 		 702 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 		 1209 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  49.46 
 
 		 688 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  43.48 
 
 		 794 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  47.25 
 
 		 1055 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  48.39 
 
 		 596 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45.63 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  49.43 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  48.94 
 
 		 763 aa  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  52.33 
 
 		 477 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.81 
 
 		 984 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  56.04 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  52.38 
 
 		 354 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  47.25 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  41.49 
 
 		 913 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  41.94 
 
 		 543 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.31 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 		 854 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  45.79 
 
 		 694 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  54.22 
 
 		 349 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  30.54 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 681 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.91 
 
 		 767 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.09 
 
 		 743 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.71 
 
 		 864 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  48.19 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  46.94 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  42.86 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  42.96 
 
 		 942 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  47.31 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.86 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  45.16 
 
 		 906 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  40.2 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.42 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.73 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  46.43 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  47.87 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  46.08 
 
 		 1121 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  46.07 
 
 		 1298 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.15 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  43.01 
 
 		 842 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>