217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6555 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  100 
 
 		 487 aa  964    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.23 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.95 
 
 		 448 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  41.59 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  44.04 
 
 		 465 aa  302  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.54 
 
 		 437 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  42.57 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.6 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  44.11 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  41.76 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.67 
 
 		 491 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  44.48 
 
 		 495 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  40.96 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  37.67 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  39.45 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  38.58 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  39.04 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  34.3 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  34.09 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.68 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  40.41 
 
 		 329 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  40.41 
 
 		 329 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  40.41 
 
 		 329 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  40.55 
 
 		 346 aa  156  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.54 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  40.62 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  39.35 
 
 		 870 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  34.9 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  36.36 
 
 		 341 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  32.76 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  58.82 
 
 		 778 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  30.92 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  56.86 
 
 		 494 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  56.07 
 
 		 727 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  31.15 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.69 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  30.82 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  31.11 
 
 		 394 aa  107  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  53.92 
 
 		 688 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.1 
 
 		 846 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  34.85 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  30.18 
 
 		 371 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  51.96 
 
 		 518 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  38.16 
 
 		 812 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  41.04 
 
 		 609 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  39.89 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.96 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 		 854 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.54 
 
 		 590 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 1209 aa  95.1  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  38.84 
 
 		 533 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 525 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.08 
 
 		 984 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.04 
 
 		 588 aa  93.6  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 913 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.95 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.57 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 		 620 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  43.52 
 
 		 488 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47.06 
 
 		 596 aa  90.5  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.56 
 
 		 767 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 		 589 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.22 
 
 		 998 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.48 
 
 		 1007 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 		 1128 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  28.99 
 
 		 487 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  46.08 
 
 		 633 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  44.35 
 
 		 785 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  43.24 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.34 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.12 
 
 		 979 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 963 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46.15 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  44.44 
 
 		 775 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  45.1 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  42.57 
 
 		 894 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  39.6 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  46.3 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  44.23 
 
 		 880 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  26.61 
 
 		 655 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.82 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  40.59 
 
 		 966 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  44.21 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.53 
 
 		 875 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 934 aa  80.9  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  24.36 
 
 		 611 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 906 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 1055 aa  77.4  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  44.55 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.26 
 
 		 763 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  37.74 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.14 
 
 		 773 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  40.5 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45.74 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 1137 aa  76.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.59 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.18 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>