62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0236 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  100 
 
 		 501 aa  1010    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  46.98 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  45.82 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  40.05 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.44 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  31.61 
 
 		 323 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  28.38 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  29.65 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.27 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  36.42 
 
 		 380 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  32.34 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  41.36 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.04 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  41.03 
 
 		 393 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  27.89 
 
 		 326 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  39.57 
 
 		 359 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  26.96 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  37.79 
 
 		 330 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  28.5 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  26.23 
 
 		 371 aa  97.8  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  39.76 
 
 		 459 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  33.18 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  36.22 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.41 
 
 		 633 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 1128 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 1209 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  35.09 
 
 		 341 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  29.53 
 
 		 767 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  26.38 
 
 		 394 aa  90.5  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  32.81 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  35.83 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  35.02 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  35.02 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  27.12 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  35.02 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  25.56 
 
 		 596 aa  88.2  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  28.64 
 
 		 655 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  27.96 
 
 		 361 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.35 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  27.02 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  39.59 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  25.68 
 
 		 548 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.2 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  27.21 
 
 		 791 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.88 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  33.86 
 
 		 870 aa  80.1  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  26.95 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  24.75 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  26.12 
 
 		 628 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.56 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.31 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.69 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  27.06 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 589 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.19 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  30.3 
 
 		 346 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 620 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  26.3 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  31.45 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.32 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  32.59 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  44.78 
 
 		 688 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>