221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3602 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  63.99 
 
 		 596 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  58.16 
 
 		 590 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  57.72 
 
 		 588 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  59.86 
 
 		 611 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 620 aa  1262    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  86.57 
 
 		 589 aa  1060    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  55.43 
 
 		 605 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  69.38 
 
 		 452 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  62.62 
 
 		 767 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  52.85 
 
 		 655 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50.8 
 
 		 623 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 		 1128 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  49.05 
 
 		 791 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.62 
 
 		 646 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.44 
 
 		 639 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  47.51 
 
 		 548 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  46.56 
 
 		 572 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 1209 aa  360  6e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  44.14 
 
 		 628 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.69 
 
 		 743 aa  300  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  32.44 
 
 		 393 aa  163  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  32.15 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.81 
 
 		 979 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  30.8 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  56.64 
 
 		 785 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  30.44 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  43.62 
 
 		 963 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  47.26 
 
 		 966 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.77 
 
 		 998 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  26.45 
 
 		 446 aa  110  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  53.4 
 
 		 854 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  45 
 
 		 488 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.01 
 
 		 491 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  51.49 
 
 		 393 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  43.24 
 
 		 743 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  53.4 
 
 		 690 aa  107  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.6 
 
 		 479 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  51.92 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  53.47 
 
 		 880 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.12 
 
 		 681 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  51.55 
 
 		 485 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  47.22 
 
 		 420 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  45.76 
 
 		 727 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  47.06 
 
 		 842 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  40.56 
 
 		 439 aa  99.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 934 aa  98.6  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.18 
 
 		 984 aa  98.2  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.62 
 
 		 775 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.25 
 
 		 609 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  39.68 
 
 		 669 aa  97.1  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  46.08 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  45.28 
 
 		 990 aa  95.5  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.41 
 
 		 455 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  46.61 
 
 		 533 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.66 
 
 		 688 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  51.11 
 
 		 938 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.63 
 
 		 494 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 376 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.79 
 
 		 499 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  47.52 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 		 812 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  36.88 
 
 		 1007 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.99 
 
 		 746 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  55.86 
 
 		 829 aa  91.3  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  44.66 
 
 		 487 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 436 aa  90.9  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.69 
 
 		 778 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.12 
 
 		 774 aa  90.5  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  28.36 
 
 		 469 aa  90.5  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  43.69 
 
 		 518 aa  90.5  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  46.53 
 
 		 442 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 		 854 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  40.16 
 
 		 875 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  36.18 
 
 		 842 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.6 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  41.03 
 
 		 744 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.45 
 
 		 913 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 633 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  41.12 
 
 		 719 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  41.44 
 
 		 974 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 1055 aa  85.5  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  37.5 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  27.32 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  41.44 
 
 		 679 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  41 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  43.14 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  43.14 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  42.16 
 
 		 894 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.85 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  39.83 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  33.74 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.05 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  45.65 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  40.78 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.55 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  40.78 
 
 		 851 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  40.57 
 
 		 935 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>