82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04176 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  70.2 
 
 		 572 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  69.02 
 
 		 628 aa  664    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  69.93 
 
 		 639 aa  671    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  100 
 
 		 548 aa  1115    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  53.49 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  55.02 
 
 		 623 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  55.18 
 
 		 1209 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  55.58 
 
 		 1128 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.3 
 
 		 646 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.93 
 
 		 767 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.87 
 
 		 633 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  50.23 
 
 		 611 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  46.7 
 
 		 743 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.2 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.86 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.62 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.5 
 
 		 588 aa  379  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  47.93 
 
 		 620 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47.24 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  45.45 
 
 		 791 aa  359  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  46.05 
 
 		 605 aa  352  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  34.47 
 
 		 393 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  34.85 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  27.13 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  27.15 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  25.83 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  26.59 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  25.27 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  27.32 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  26.18 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  28.04 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  24.32 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  27.44 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  23.98 
 
 		 870 aa  67  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  26.09 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  26.06 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  26.15 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  26.15 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  26.15 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  27.21 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.24 
 
 		 834 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  28.12 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.42 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  25.23 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  24.13 
 
 		 323 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  28.17 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  26.46 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  26.53 
 
 		 438 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.67 
 
 		 1295 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.48 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  40.74 
 
 		 1067 aa  54.3  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  41.3 
 
 		 3802 aa  53.5  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  46.38 
 
 		 1115 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 9585 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  35.29 
 
 		 1307 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.71 
 
 		 1773 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  24.79 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  32.21 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  23.53 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  32.43 
 
 		 1199 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  37.5 
 
 		 1847 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  46.91 
 
 		 683 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  44.44 
 
 		 782 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  30 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 495 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  39.81 
 
 		 767 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.55 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  39.56 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  37 
 
 		 1401 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.88 
 
 		 3027 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  38.82 
 
 		 2286 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  42.17 
 
 		 692 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.25 
 
 		 2334 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.91 
 
 		 3197 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  44.44 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  36.63 
 
 		 771 aa  44.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.82 
 
 		 649 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.26 
 
 		 703 aa  44.3  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  33.71 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  33.77 
 
 		 948 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.5 
 
 		 795 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>