275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1150 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  69.3 
 
 
646 aa  643    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  100 
 
 
655 aa  1315    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  68.96 
 
 
623 aa  641    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  58.67 
 
 
1209 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  53.49 
 
 
548 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  56.54 
 
 
572 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.02 
 
 
639 aa  505  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  54.02 
 
 
628 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.49 
 
 
743 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  56.07 
 
 
767 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.32 
 
 
633 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  56.71 
 
 
1128 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  55.5 
 
 
611 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  54.04 
 
 
596 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  52.57 
 
 
791 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  53.03 
 
 
605 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  52.63 
 
 
620 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.22 
 
 
452 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.18 
 
 
588 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.18 
 
 
590 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  51.61 
 
 
589 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  90.91 
 
 
900 aa  326  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  35.55 
 
 
393 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  33.49 
 
 
450 aa  167  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  51.52 
 
 
649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 
658 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  45.5 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  45.56 
 
 
443 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  46.2 
 
 
543 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.58 
 
 
847 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  44 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  44.44 
 
 
681 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.12 
 
 
998 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.03 
 
 
880 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.95 
 
 
674 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.2 
 
 
674 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  36.96 
 
 
978 aa  97.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  28.76 
 
 
469 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29.32 
 
 
674 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 
674 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  29.48 
 
 
419 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.29 
 
 
460 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.32 
 
 
674 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.32 
 
 
674 aa  95.1  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.32 
 
 
674 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29.32 
 
 
674 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  54.21 
 
 
468 aa  94.4  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.32 
 
 
674 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.19 
 
 
674 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  46.49 
 
 
455 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  46.49 
 
 
455 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  50.98 
 
 
614 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  28.92 
 
 
341 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  51.11 
 
 
820 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.32 
 
 
543 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.12 
 
 
429 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  44.74 
 
 
455 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45.61 
 
 
455 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  38.89 
 
 
637 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.94 
 
 
973 aa  87  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.64 
 
 
1121 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  30.54 
 
 
330 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  28.1 
 
 
380 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  45.61 
 
 
455 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  43.86 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  43.86 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  28.64 
 
 
501 aa  86.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  44.66 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 
674 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  43.86 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  52.22 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  30.11 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  30.11 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  30.11 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  42.98 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  42.98 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  42.11 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  52.17 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  51.4 
 
 
924 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  43.86 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.02 
 
 
809 aa  84  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  53.93 
 
 
1154 aa  84  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.91 
 
 
552 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  44.8 
 
 
1887 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  44.12 
 
 
787 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  48.96 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  26.42 
 
 
323 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 
1137 aa  82  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  45.54 
 
 
749 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  28.88 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.56 
 
 
795 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  28.1 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  39.47 
 
 
456 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  27.54 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  35.42 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  48.35 
 
 
351 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  54.84 
 
 
2170 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  48.11 
 
 
702 aa  78.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  43.14 
 
 
660 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  37.84 
 
 
727 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>