More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1822 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 429 aa  851    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  51.13 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  40.81 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  52.65 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  48.29 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  48.56 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  54.63 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  50.44 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  47.16 
 
 		 347 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  46.7 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  49.52 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 		 358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  50.5 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  46.45 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  49.55 
 
 		 681 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  46.48 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  50.77 
 
 		 389 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  50.26 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  44.78 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  49.54 
 
 		 543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  50.53 
 
 		 727 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  44.17 
 
 		 285 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  48.47 
 
 		 212 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.48 
 
 		 998 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  47.47 
 
 		 978 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  42.38 
 
 		 880 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  40.61 
 
 		 847 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  48.76 
 
 		 743 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  47.15 
 
 		 608 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  41.95 
 
 		 637 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 		 658 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.23 
 
 		 1007 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  28.64 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  36.25 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  36.89 
 
 		 699 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  40.19 
 
 		 1137 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  53.64 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  46.84 
 
 		 973 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  43.09 
 
 		 900 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.37 
 
 		 1121 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.25 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.25 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  41.12 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  42.23 
 
 		 938 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  34.8 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  35.81 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  42 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  34.02 
 
 		 674 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.23 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  34.02 
 
 		 674 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50.48 
 
 		 623 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  39.11 
 
 		 523 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  50.48 
 
 		 842 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.98 
 
 		 649 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  46.6 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  28.36 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.71 
 
 		 456 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 		 674 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.06 
 
 		 518 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.06 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 688 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.06 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.06 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  45.19 
 
 		 773 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  33.8 
 
 		 674 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.04 
 
 		 778 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 906 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.99 
 
 		 674 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 746 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  27.76 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  39.32 
 
 		 679 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.23 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  36.04 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  36.86 
 
 		 614 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 934 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.06 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  46.3 
 
 		 851 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.23 
 
 		 925 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.02 
 
 		 674 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.47 
 
 		 674 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  27.84 
 
 		 455 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.12 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  46.6 
 
 		 489 aa  93.6  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  48.04 
 
 		 990 aa  94  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.47 
 
 		 674 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.47 
 
 		 674 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.47 
 
 		 674 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 744 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  42.99 
 
 		 875 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  38.89 
 
 		 543 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  27.46 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.45 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.18 
 
 		 984 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  46.3 
 
 		 690 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.37 
 
 		 646 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  38.77 
 
 		 719 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  46.3 
 
 		 854 aa  89.7  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>