More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0388 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 		 442 aa  898    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  63.43 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  61.03 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  56.17 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  57.96 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  55.86 
 
 		 656 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  57.19 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  56.47 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  54.86 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  42.3 
 
 		 306 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  40.77 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  38.36 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  40.77 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  42.39 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  34.57 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  35.07 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  37.23 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  33.09 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  35.69 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  33.21 
 
 		 343 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  33.46 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  31 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  66 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  28.94 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  67 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  30.92 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  31.36 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  28.2 
 
 		 363 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  33.96 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  32.21 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  32.21 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  32.97 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  28.37 
 
 		 363 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.8 
 
 		 998 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  48.08 
 
 		 934 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  47.57 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  47.57 
 
 		 842 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  40.43 
 
 		 669 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  52.48 
 
 		 743 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.99 
 
 		 580 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.88 
 
 		 942 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 628 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 488 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 778 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.08 
 
 		 925 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 688 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49 
 
 		 596 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  50.5 
 
 		 681 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  51.89 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  42.45 
 
 		 775 aa  99.8  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  46.67 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  44.66 
 
 		 990 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  46.08 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  39.62 
 
 		 875 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  45.71 
 
 		 597 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  42.06 
 
 		 880 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  41.54 
 
 		 794 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 744 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  45.37 
 
 		 486 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  27.2 
 
 		 343 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.27 
 
 		 984 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42.57 
 
 		 727 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  37.59 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  44.86 
 
 		 854 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  53.61 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46.23 
 
 		 773 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  55.81 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  44.86 
 
 		 690 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  50.49 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.44 
 
 		 646 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.57 
 
 		 588 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  42 
 
 		 590 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.86 
 
 		 499 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  30.95 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  44.76 
 
 		 785 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  50.6 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  45.79 
 
 		 1007 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.34 
 
 		 913 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.31 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.06 
 
 		 979 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  46.53 
 
 		 620 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.55 
 
 		 767 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.55 
 
 		 812 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 		 846 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.31 
 
 		 609 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 935 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  31.58 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 746 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.96 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  29.5 
 
 		 544 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  40.5 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  41.9 
 
 		 491 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  27.53 
 
 		 315 aa  86.3  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  48.42 
 
 		 938 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  39.81 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 966 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  43.52 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  39.81 
 
 		 1055 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>