More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2633 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
422 aa  859    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  56.34 
 
 
442 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  55.72 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  52.06 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  48.23 
 
 
432 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  56.38 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  56.03 
 
 
518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  47.69 
 
 
656 aa  285  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50.34 
 
 
489 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  97.03 
 
 
456 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  41.03 
 
 
414 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  42.47 
 
 
419 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  42.86 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  36.67 
 
 
306 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  38.11 
 
 
417 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  38.64 
 
 
331 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  35.77 
 
 
381 aa  166  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  32.73 
 
 
392 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  32.74 
 
 
394 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  35.07 
 
 
392 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  34.34 
 
 
343 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  35 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  32.26 
 
 
317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  33.57 
 
 
363 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  63.93 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  35.16 
 
 
368 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.54 
 
 
366 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  31.23 
 
 
363 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.54 
 
 
529 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  57.58 
 
 
372 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  52.48 
 
 
773 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  30.45 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  30.45 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  33.56 
 
 
342 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  44.76 
 
 
847 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  55.88 
 
 
448 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  53.1 
 
 
702 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  54.35 
 
 
486 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  52 
 
 
366 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  54.76 
 
 
925 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  53.06 
 
 
477 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  55.43 
 
 
673 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  50.5 
 
 
460 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  48.08 
 
 
493 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  55.56 
 
 
441 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  29.13 
 
 
343 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  55.34 
 
 
978 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  57.45 
 
 
460 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  50 
 
 
449 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.9 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  55.29 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  49.47 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  45.19 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  51.02 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  53.01 
 
 
494 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  52.63 
 
 
451 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  29.18 
 
 
372 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  51.14 
 
 
744 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.06 
 
 
491 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.88 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42.61 
 
 
609 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
658 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  30 
 
 
315 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  45.63 
 
 
459 aa  93.6  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 
812 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  34.01 
 
 
545 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  54.65 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.65 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  50 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  53.41 
 
 
593 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  51.04 
 
 
453 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  45.35 
 
 
543 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  27.72 
 
 
544 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  49.48 
 
 
349 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.45 
 
 
499 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 
984 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  48.84 
 
 
743 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  47.47 
 
 
669 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 
1209 aa  89.7  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  27.84 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  60 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  27.42 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  40.91 
 
 
864 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.05 
 
 
913 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  46.67 
 
 
911 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  57.78 
 
 
89 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  25.91 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  37.9 
 
 
681 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  43.75 
 
 
694 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.82 
 
 
613 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  36.81 
 
 
468 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  27.92 
 
 
414 aa  87  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  48.42 
 
 
785 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.38 
 
 
429 aa  86.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  47.42 
 
 
678 aa  86.3  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.19 
 
 
778 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  45.35 
 
 
1055 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.27 
 
 
979 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  45.35 
 
 
774 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>