165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3660 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
381 aa  786    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  54.21 
 
 
394 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  55.74 
 
 
317 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  54.33 
 
 
392 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  51.95 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  50.68 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  52.07 
 
 
529 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  52.86 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  43.35 
 
 
366 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  51.27 
 
 
363 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  43.73 
 
 
417 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  42.37 
 
 
419 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  44.1 
 
 
331 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  46.6 
 
 
368 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  44.9 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  44.59 
 
 
343 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  47 
 
 
342 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  40.82 
 
 
450 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  43.1 
 
 
308 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  43.1 
 
 
308 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  39.02 
 
 
436 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  35.99 
 
 
343 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  37.76 
 
 
315 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  35.58 
 
 
656 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  39.01 
 
 
423 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  35.92 
 
 
308 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3281  PHB depolymerase family esterase  35.92 
 
 
308 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.123573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3457  PHB depolymerase family esterase  35.92 
 
 
308 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00100534  normal  0.0484591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  37.07 
 
 
432 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  35.11 
 
 
442 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  33.09 
 
 
518 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  34.47 
 
 
451 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  35.77 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  34.93 
 
 
489 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  34.14 
 
 
367 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3172  esterase, PHB depolymerase family protein  32.88 
 
 
300 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  31.89 
 
 
372 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  32.27 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  31.33 
 
 
387 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  32.4 
 
 
419 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  30 
 
 
306 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.08 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  32.08 
 
 
544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  33.11 
 
 
396 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  31.29 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  34.44 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.9 
 
 
334 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  34.07 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  32.95 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  32.71 
 
 
414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  31.4 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  32.96 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  36.5 
 
 
429 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  34.32 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  34.71 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  31.58 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  35.85 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  32.62 
 
 
343 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  29.23 
 
 
359 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  33.56 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  32.86 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  32.32 
 
 
373 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  33.46 
 
 
422 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  33.46 
 
 
422 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  32.54 
 
 
419 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  34.76 
 
 
403 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  30.98 
 
 
416 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  31.83 
 
 
438 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  31.23 
 
 
337 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  39.33 
 
 
466 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  26.69 
 
 
352 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  38.76 
 
 
426 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  32.33 
 
 
425 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  30.86 
 
 
398 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  32.22 
 
 
410 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  32.67 
 
 
369 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  32.65 
 
 
419 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  30.04 
 
 
398 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  33.53 
 
 
338 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.32 
 
 
367 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.32 
 
 
367 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.32 
 
 
364 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  33.21 
 
 
394 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.32 
 
 
382 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.32 
 
 
382 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  30.32 
 
 
382 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  30.32 
 
 
382 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  32.83 
 
 
342 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.62 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  30.32 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  32.28 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  32.28 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  32.28 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  41.48 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  30.37 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  31.53 
 
 
355 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  32.18 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  31.94 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  31.94 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.81 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>