238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2138 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  56.16 
 
 
906 aa  783    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  58.28 
 
 
911 aa  837    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  57.71 
 
 
925 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  58.32 
 
 
913 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  54.11 
 
 
1298 aa  788    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  59.73 
 
 
842 aa  875    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  52.46 
 
 
978 aa  876    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  56.43 
 
 
935 aa  787    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
942 aa  1877    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  47.82 
 
 
873 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  53.62 
 
 
934 aa  739    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  55.5 
 
 
1904 aa  820    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  45.92 
 
 
836 aa  585  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  40.16 
 
 
1288 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01542  oligo-xyloglucan specific cellobiohydrolase (Eurofung)  37.74 
 
 
810 aa  422  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.73 
 
 
707 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.5 
 
 
778 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45.7 
 
 
846 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 
609 aa  121  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  49.12 
 
 
669 aa  118  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 
812 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  51.85 
 
 
628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.49 
 
 
590 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  51.96 
 
 
596 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  54.37 
 
 
743 aa  105  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.49 
 
 
588 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  52.88 
 
 
681 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  43.8 
 
 
794 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  42.74 
 
 
773 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  48.11 
 
 
746 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 
633 aa  98.2  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.55 
 
 
744 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  46.08 
 
 
486 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  47.01 
 
 
605 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46.53 
 
 
436 aa  94.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  46.43 
 
 
420 aa  94.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 
966 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
1055 aa  93.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  42.86 
 
 
489 aa  93.2  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  45.19 
 
 
442 aa  93.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.28 
 
 
499 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  45.05 
 
 
864 aa  92  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.15 
 
 
469 aa  91.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  47.22 
 
 
854 aa  91.3  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  49.02 
 
 
488 aa  90.9  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.35 
 
 
491 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  44.23 
 
 
393 aa  90.1  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  47.62 
 
 
446 aa  89.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  44.23 
 
 
423 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  46.08 
 
 
842 aa  88.2  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 
963 aa  87.8  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 
854 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  39.66 
 
 
694 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
1128 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.6 
 
 
774 aa  85.9  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  38.24 
 
 
894 aa  85.9  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.27 
 
 
623 aa  85.9  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 
847 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  44.34 
 
 
597 aa  85.5  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.27 
 
 
842 aa  85.1  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  47.47 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  41.75 
 
 
974 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.07 
 
 
479 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.81 
 
 
984 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.18 
 
 
487 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  43.12 
 
 
495 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.86 
 
 
767 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.55 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 
438 aa  82  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.16 
 
 
979 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  39.81 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  40.37 
 
 
785 aa  81.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 
1209 aa  80.9  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  41.18 
 
 
990 aa  80.1  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  42.72 
 
 
611 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  47.87 
 
 
763 aa  80.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.6 
 
 
998 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  39.29 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  41.28 
 
 
580 aa  79  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  43.12 
 
 
389 aa  79  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.12 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.46 
 
 
875 aa  77.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  35.51 
 
 
543 aa  77  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  37.4 
 
 
775 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  42.11 
 
 
690 aa  77  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  40.95 
 
 
880 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.86 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  45.1 
 
 
525 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  41.75 
 
 
778 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.9 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.43 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
1137 aa  75.1  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  38.83 
 
 
688 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  41.51 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  41.35 
 
 
432 aa  74.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.39 
 
 
366 aa  73.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  25.41 
 
 
1054 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  44.68 
 
 
403 aa  73.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  38.83 
 
 
518 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  47.66 
 
 
829 aa  72.4  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>