212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2448 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  57.84 
 
 		 842 aa  762    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  54.19 
 
 		 854 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  65.33 
 
 		 984 aa  1013    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.65 
 
 		 979 aa  893    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  57.78 
 
 		 900 aa  737    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  58.41 
 
 		 1121 aa  758    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  57.57 
 
 		 973 aa  782    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  58.71 
 
 		 966 aa  833    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  57.81 
 
 		 963 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  63.45 
 
 		 785 aa  829    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  59.53 
 
 		 854 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.72 
 
 		 919 aa  667    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 894 aa  1810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  51.93 
 
 		 722 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  56.01 
 
 		 1478 aa  727    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  56.01 
 
 		 1904 aa  723    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  56.01 
 
 		 1759 aa  726    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  61.46 
 
 		 974 aa  1004    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  50.93 
 
 		 741 aa  628  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.48 
 
 		 938 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.02 
 
 		 590 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.26 
 
 		 588 aa  129  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  51.2 
 
 		 1128 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 		 633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  48.25 
 
 		 420 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  46.02 
 
 		 609 aa  111  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.48 
 
 		 669 aa  106  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.65 
 
 		 767 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  44.55 
 
 		 596 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  42.25 
 
 		 605 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 775 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 		 812 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47 
 
 		 846 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  52.88 
 
 		 389 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 628 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  51.49 
 
 		 934 aa  101  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  41.73 
 
 		 589 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  39.1 
 
 		 842 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  45.54 
 
 		 623 aa  99.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  41.94 
 
 		 488 aa  97.8  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.09 
 
 		 479 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 525 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  43.69 
 
 		 436 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  42.31 
 
 		 620 aa  95.5  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 562 aa  95.1  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47 
 
 		 393 aa  94.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  53.33 
 
 		 938 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  42.19 
 
 		 486 aa  94.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  41.6 
 
 		 533 aa  94.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.06 
 
 		 746 aa  94  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.63 
 
 		 494 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  42.16 
 
 		 990 aa  92.8  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  45 
 
 		 727 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 1055 aa  91.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  40.78 
 
 		 743 aa  91.3  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  42.16 
 
 		 518 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 1209 aa  90.9  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 763 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 688 aa  90.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  37.93 
 
 		 744 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  44.55 
 
 		 880 aa  90.1  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.59 
 
 		 773 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.44 
 
 		 459 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 		 925 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  41.75 
 
 		 778 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  39.84 
 
 		 875 aa  88.2  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42 
 
 		 580 aa  87.8  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  39.22 
 
 		 681 aa  87.8  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.62 
 
 		 495 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  37.37 
 
 		 2305 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  48.91 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  38.24 
 
 		 942 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.27 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.59 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  38.24 
 
 		 913 aa  85.5  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  41 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  41 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 		 364 aa  84  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  43.14 
 
 		 491 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 1298 aa  84  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.03 
 
 		 633 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  36.23 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  42.57 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  44.57 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  45.05 
 
 		 1007 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.86 
 
 		 646 aa  82  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  45.65 
 
 		 743 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  38.24 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  38.81 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.58 
 
 		 998 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 1137 aa  80.9  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.67 
 
 		 485 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  36.84 
 
 		 851 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  32.12 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.83 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  44.12 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  40.95 
 
 		 894 aa  78.6  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  31.03 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.29 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>