210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4288 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  100 
 
 		 420 aa  839    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  46.7 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  40.61 
 
 		 842 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  52.54 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1699  hypothetical protein  42.92 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.66 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  54.9 
 
 		 596 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.26 
 
 		 588 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  55 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  47.37 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 		 966 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.53 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 963 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  50.46 
 
 		 846 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  50.5 
 
 		 894 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 		 854 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 		 589 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 812 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.96 
 
 		 984 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  47.22 
 
 		 743 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 1128 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  43.41 
 
 		 620 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.93 
 
 		 767 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.04 
 
 		 609 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  48.08 
 
 		 746 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  43.26 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  46.61 
 
 		 785 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  50.96 
 
 		 727 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.96 
 
 		 646 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  51.43 
 
 		 690 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.6 
 
 		 681 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  43.31 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.51 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  56.04 
 
 		 743 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 688 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  51.43 
 
 		 854 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  52.48 
 
 		 775 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  60.24 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  53.4 
 
 		 459 aa  96.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50 
 
 		 494 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  47.06 
 
 		 778 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.63 
 
 		 628 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  49.5 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.43 
 
 		 942 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 913 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 518 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  48.45 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  50.96 
 
 		 533 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 1055 aa  92.8  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.52 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 		 633 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  45.9 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.88 
 
 		 979 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  54.26 
 
 		 763 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  45.1 
 
 		 611 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  37.24 
 
 		 875 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  46.67 
 
 		 608 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  45.28 
 
 		 880 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  46 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  43.56 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  50.94 
 
 		 935 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 774 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.71 
 
 		 998 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.72 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.27 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  47.42 
 
 		 1007 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 562 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  51.69 
 
 		 938 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  52.13 
 
 		 1209 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  44.55 
 
 		 487 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  55.26 
 
 		 829 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  33.74 
 
 		 486 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  34.34 
 
 		 773 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  41.8 
 
 		 974 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 934 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  45.1 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  45.54 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  51.06 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 925 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.88 
 
 		 633 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  50 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.83 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40.57 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  30.77 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40.57 
 
 		 842 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.34 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 		 990 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  47.87 
 
 		 673 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.06 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  42.72 
 
 		 1042 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.68 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  51.69 
 
 		 1298 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.93 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  40.78 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.09 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  42 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>