241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6685 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  100 
 
 		 533 aa  1072    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  59.33 
 
 		 525 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  37.91 
 
 		 362 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 633 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  31.3 
 
 		 1194 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.19 
 
 		 633 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  45.18 
 
 		 963 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 966 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  52.94 
 
 		 775 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  49.55 
 
 		 767 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.51 
 
 		 984 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  49.17 
 
 		 1007 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.56 
 
 		 979 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  46.67 
 
 		 727 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  51.49 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.61 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.22 
 
 		 1128 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.96 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  55.32 
 
 		 938 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  45.27 
 
 		 589 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  51.46 
 
 		 596 aa  104  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  49.5 
 
 		 609 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  29.72 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 812 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  40.54 
 
 		 605 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50.48 
 
 		 494 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.52 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.6 
 
 		 588 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  43.54 
 
 		 620 aa  97.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  36.2 
 
 		 455 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 376 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 688 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 		 854 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  52.48 
 
 		 935 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.58 
 
 		 875 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  46.49 
 
 		 785 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.83 
 
 		 420 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45.54 
 
 		 436 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  35.71 
 
 		 773 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  43.69 
 
 		 487 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  50 
 
 		 719 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  48.42 
 
 		 403 aa  93.6  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  49.47 
 
 		 763 aa  93.6  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.56 
 
 		 998 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.42 
 
 		 1209 aa  93.2  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  45.54 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  31.37 
 
 		 842 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  45.54 
 
 		 880 aa  90.1  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.53 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  45.63 
 
 		 894 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.44 
 
 		 743 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.55 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  45.54 
 
 		 543 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 628 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.32 
 
 		 479 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.55 
 
 		 846 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  49.54 
 
 		 829 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 934 aa  87  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  39.25 
 
 		 746 aa  87  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.69 
 
 		 491 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.24 
 
 		 744 aa  86.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  44.55 
 
 		 990 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.14 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.37 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  52.81 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  44.23 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  40.17 
 
 		 974 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.75 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  42.31 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  47.73 
 
 		 1298 aa  85.1  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  40.19 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  41.58 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  39.42 
 
 		 913 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  48.19 
 
 		 1137 aa  83.6  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40.59 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  35.94 
 
 		 743 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  52.69 
 
 		 1121 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  44.66 
 
 		 854 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  41.58 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  41.96 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  40.43 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  42.57 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  38.83 
 
 		 794 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.78 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40.59 
 
 		 842 aa  80.5  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 1055 aa  80.5  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  37.68 
 
 		 669 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 894 aa  80.5  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  42.31 
 
 		 774 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  38.18 
 
 		 851 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 681 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.72 
 
 		 646 aa  80.1  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  36.28 
 
 		 864 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  39.22 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  42.24 
 
 		 1042 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  42.57 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  35.66 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40.46 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  41.58 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40.43 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>