241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2022 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  53.43 
 
 		 787 aa  652    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  67.9 
 
 		 669 aa  837    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  55.54 
 
 		 1880 aa  646    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  55.74 
 
 		 1065 aa  656    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  100 
 
 		 743 aa  1493    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  57.5 
 
 		 914 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  66.5 
 
 		 774 aa  748    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  56.16 
 
 		 1266 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  55.04 
 
 		 677 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  64.27 
 
 		 820 aa  748    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  54.35 
 
 		 618 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  65.79 
 
 		 773 aa  1015    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  53.96 
 
 		 672 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  61.39 
 
 		 676 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.89 
 
 		 833 aa  655    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  62.6 
 
 		 746 aa  883    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  68.16 
 
 		 744 aa  974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  50.5 
 
 		 662 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  49.84 
 
 		 613 aa  568  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  48.61 
 
 		 616 aa  558  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  49.29 
 
 		 658 aa  545  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  37.83 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  73.64 
 
 		 240 aa  353  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  37.59 
 
 		 1082 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  36.7 
 
 		 851 aa  291  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  42.11 
 
 		 767 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  40.05 
 
 		 803 aa  276  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  31.26 
 
 		 606 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  69.75 
 
 		 488 aa  168  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  66.02 
 
 		 681 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  65.09 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.09 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  56.6 
 
 		 469 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.04 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  63.27 
 
 		 485 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  58.1 
 
 		 495 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  55.97 
 
 		 446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  59.22 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  48.63 
 
 		 605 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  53.72 
 
 		 785 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  60.4 
 
 		 393 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.37 
 
 		 590 aa  120  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  55.34 
 
 		 628 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.55 
 
 		 767 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.84 
 
 		 979 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  42.95 
 
 		 633 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  58.82 
 
 		 925 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  48.95 
 
 		 486 aa  117  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  54.13 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  56.44 
 
 		 436 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 1128 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  48.7 
 
 		 974 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.86 
 
 		 984 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50.98 
 
 		 494 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  46.56 
 
 		 589 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 688 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.38 
 
 		 455 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  51.96 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  45.69 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  47.57 
 
 		 611 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  56.25 
 
 		 829 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 846 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.29 
 
 		 842 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50 
 
 		 913 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  54.81 
 
 		 942 aa  107  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 778 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  51.92 
 
 		 442 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  40.88 
 
 		 620 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  49.06 
 
 		 420 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  42.52 
 
 		 854 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 1055 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  50.48 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  49.12 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  51.96 
 
 		 623 aa  102  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  45.38 
 
 		 543 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  51.96 
 
 		 842 aa  100  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 812 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.08 
 
 		 681 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 489 aa  99.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  47.06 
 
 		 487 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  46.3 
 
 		 966 aa  98.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  43.9 
 
 		 963 aa  97.8  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  44.86 
 
 		 864 aa  97.4  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 376 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  43.31 
 
 		 366 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  46.85 
 
 		 794 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.67 
 
 		 998 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  47.52 
 
 		 880 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  43.93 
 
 		 438 aa  95.5  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  46.73 
 
 		 894 aa  95.1  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 935 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  46.15 
 
 		 990 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  47.06 
 
 		 851 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  45.19 
 
 		 460 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.54 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42.11 
 
 		 727 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  45.54 
 
 		 906 aa  92  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 894 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  47.78 
 
 		 456 aa  91.3  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>