213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2372 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
842 aa  1739    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  43.97 
 
 
611 aa  355  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  44.3 
 
 
389 aa  306  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  39.29 
 
 
420 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  47.23 
 
 
439 aa  229  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1699  hypothetical protein  46.32 
 
 
355 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217721 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  33.59 
 
 
1057 aa  197  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  48.46 
 
 
854 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  54.74 
 
 
1128 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  60.91 
 
 
846 aa  137  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  42.79 
 
 
633 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  51.82 
 
 
609 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
812 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.23 
 
 
455 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  38.74 
 
 
773 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50.96 
 
 
913 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.78 
 
 
590 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.88 
 
 
984 aa  111  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  52.88 
 
 
628 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  44.37 
 
 
605 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  51 
 
 
596 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.11 
 
 
588 aa  104  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  45.53 
 
 
1042 aa  104  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  34.13 
 
 
486 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  40.32 
 
 
488 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.27 
 
 
491 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  44.86 
 
 
746 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  43.28 
 
 
669 aa  102  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  46.23 
 
 
495 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.65 
 
 
499 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.69 
 
 
479 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  42.86 
 
 
743 aa  99.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  43 
 
 
894 aa  98.2  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  48.28 
 
 
694 aa  97.8  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  41.46 
 
 
525 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  48.51 
 
 
774 aa  95.5  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  43.24 
 
 
543 aa  94.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  42.31 
 
 
775 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.55 
 
 
688 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  45.28 
 
 
459 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.56 
 
 
778 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  45.63 
 
 
925 aa  93.2  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  43 
 
 
469 aa  92.8  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  44 
 
 
681 aa  92.8  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.27 
 
 
906 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  37.5 
 
 
974 aa  92  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.52 
 
 
393 aa  91.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  40.65 
 
 
875 aa  91.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  42.57 
 
 
518 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
966 aa  91.3  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.5 
 
 
633 aa  91.3  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 
963 aa  89.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.64 
 
 
942 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  43.27 
 
 
436 aa  89.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  36.09 
 
 
767 aa  88.6  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.31 
 
 
580 aa  88.2  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.58 
 
 
494 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.68 
 
 
744 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  43.69 
 
 
489 aa  87.4  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  38.83 
 
 
990 aa  86.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.19 
 
 
998 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  40.65 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  36.29 
 
 
533 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  41.13 
 
 
851 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.93 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  40.62 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  41.67 
 
 
1055 aa  85.1  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  39.84 
 
 
864 aa  85.1  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.22 
 
 
743 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  41 
 
 
740 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  48.72 
 
 
829 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  40.78 
 
 
880 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.05 
 
 
474 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 
620 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  39.81 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  46.59 
 
 
460 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  40 
 
 
593 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  44.21 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  42.16 
 
 
623 aa  82.4  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  44.68 
 
 
938 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  42.31 
 
 
935 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  41.12 
 
 
934 aa  82  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.42 
 
 
847 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.35 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  42.99 
 
 
719 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.59 
 
 
979 aa  81.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.55 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  44.57 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  37.84 
 
 
727 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  39.26 
 
 
446 aa  80.9  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 
589 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  38.53 
 
 
794 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 
1209 aa  78.6  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.18 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.48 
 
 
763 aa  78.2  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  36.94 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  43.9 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  33.88 
 
 
785 aa  77.4  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 
894 aa  76.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 
358 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>