283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2167 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.27 
 
 		 984 aa  1194    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.05 
 
 		 979 aa  1098    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  59.59 
 
 		 973 aa  811    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.46 
 
 		 919 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  52.02 
 
 		 963 aa  981    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  61.06 
 
 		 842 aa  820    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  63.04 
 
 		 785 aa  858    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  55.93 
 
 		 854 aa  754    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  57.7 
 
 		 854 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  55.43 
 
 		 722 aa  704    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  54.91 
 
 		 1478 aa  725    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  58.23 
 
 		 900 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  58.97 
 
 		 1121 aa  783    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  61.33 
 
 		 894 aa  1004    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  54.91 
 
 		 1904 aa  722    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 974 aa  1979    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  54.91 
 
 		 1759 aa  724    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  52.97 
 
 		 966 aa  986    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.77 
 
 		 938 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  49.69 
 
 		 741 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.52 
 
 		 767 aa  231  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  57.93 
 
 		 605 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.92 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  45.24 
 
 		 488 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.56 
 
 		 491 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  55.34 
 
 		 774 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.55 
 
 		 743 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  47.32 
 
 		 744 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 1055 aa  109  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 		 633 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.65 
 
 		 479 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.79 
 
 		 669 aa  106  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.32 
 
 		 499 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  45.1 
 
 		 681 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  47.17 
 
 		 746 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.24 
 
 		 486 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  49.02 
 
 		 681 aa  98.2  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.22 
 
 		 459 aa  97.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 		 620 aa  97.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.04 
 
 		 925 aa  96.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  46.08 
 
 		 880 aa  97.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  48.51 
 
 		 543 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.12 
 
 		 773 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  44.66 
 
 		 611 aa  95.9  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 		 1128 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.67 
 
 		 998 aa  95.5  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  44.12 
 
 		 596 aa  95.1  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.3 
 
 		 609 aa  95.1  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.54 
 
 		 646 aa  94.7  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  34.62 
 
 		 652 aa  94.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  37.14 
 
 		 589 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  42.94 
 
 		 1053 aa  94  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  44.35 
 
 		 1152 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  47.57 
 
 		 690 aa  92.8  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.82 
 
 		 842 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  49.5 
 
 		 393 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.04 
 
 		 489 aa  92.8  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.38 
 
 		 590 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.08 
 
 		 588 aa  92.8  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40.85 
 
 		 495 aa  92  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.99 
 
 		 864 aa  91.3  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  44.79 
 
 		 485 aa  91.3  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.73 
 
 		 446 aa  90.9  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  45.79 
 
 		 719 aa  90.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.45 
 
 		 846 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  41.35 
 
 		 990 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  43.7 
 
 		 533 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  48.35 
 
 		 1132 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 436 aa  89.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 913 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  30.56 
 
 		 1123 aa  89.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  44 
 
 		 597 aa  89  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  42.73 
 
 		 420 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.64 
 
 		 366 aa  87.8  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.5 
 
 		 703 aa  87.4  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  39.02 
 
 		 525 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  45.71 
 
 		 775 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 906 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.78 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.86 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 812 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.75 
 
 		 623 aa  84  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  41.75 
 
 		 942 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  41.18 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 934 aa  82.4  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.14 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  49.55 
 
 		 829 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.71 
 
 		 847 aa  82.4  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.33 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  39.81 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45.65 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  43.88 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  39.02 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  29.31 
 
 		 1042 aa  81.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.16 
 
 		 494 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.78 
 
 		 456 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.24 
 
 		 875 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  48.96 
 
 		 1127 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  48.96 
 
 		 1127 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 778 aa  79  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>