215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05945 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  89.66 
 
 		 1054 aa  1971    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  54.5 
 
 		 855 aa  803    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  51.75 
 
 		 772 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  54.2 
 
 		 1146 aa  1011    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  47.74 
 
 		 997 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  53.2 
 
 		 1129 aa  980    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  52.29 
 
 		 1127 aa  991    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  52.25 
 
 		 1127 aa  997    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  100 
 
 		 1053 aa  2159    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  52.45 
 
 		 1127 aa  1003    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  78.07 
 
 		 1051 aa  1595    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  47.26 
 
 		 760 aa  668    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 		 904 aa  808    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  51.94 
 
 		 1127 aa  987    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.68 
 
 		 703 aa  230  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  38.51 
 
 		 484 aa  207  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.32 
 
 		 372 aa  192  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  44.71 
 
 		 846 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 674 aa  173  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.25 
 
 		 634 aa  172  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.99 
 
 		 674 aa  168  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.99 
 
 		 674 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.99 
 
 		 674 aa  167  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.99 
 
 		 674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.99 
 
 		 674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.99 
 
 		 674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  29.13 
 
 		 674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.93 
 
 		 674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.91 
 
 		 674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  38.1 
 
 		 846 aa  166  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 652 aa  164  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  39.61 
 
 		 848 aa  160  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  27.48 
 
 		 482 aa  159  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.31 
 
 		 431 aa  149  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  46.27 
 
 		 1152 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.69 
 
 		 382 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.59 
 
 		 846 aa  140  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.66 
 
 		 639 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.56 
 
 		 499 aa  132  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  26.03 
 
 		 377 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  25.9 
 
 		 1271 aa  124  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1080 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  39.68 
 
 		 1123 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  26.62 
 
 		 867 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  26.97 
 
 		 848 aa  119  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  26.7 
 
 		 868 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  25.76 
 
 		 396 aa  118  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 868 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.16 
 
 		 848 aa  115  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 868 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  25.93 
 
 		 505 aa  114  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  25.59 
 
 		 855 aa  114  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  27.07 
 
 		 559 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  26.42 
 
 		 868 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  25.71 
 
 		 868 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  25.65 
 
 		 563 aa  109  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  25.81 
 
 		 972 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  30.06 
 
 		 521 aa  108  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  39.11 
 
 		 1285 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  25.17 
 
 		 373 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  24.2 
 
 		 762 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.34 
 
 		 398 aa  105  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.07 
 
 		 763 aa  105  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  29.9 
 
 		 401 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  27.53 
 
 		 414 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  27.1 
 
 		 430 aa  104  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 1578 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.2 
 
 		 463 aa  101  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  27.34 
 
 		 869 aa  101  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 1246 aa  99.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  27.93 
 
 		 425 aa  99.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  26.14 
 
 		 652 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.45 
 
 		 388 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.64 
 
 		 1362 aa  97.8  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.31 
 
 		 1059 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  42.02 
 
 		 1219 aa  97.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.22 
 
 		 455 aa  97.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 465 aa  94.7  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  28.36 
 
 		 586 aa  94.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  26.19 
 
 		 563 aa  93.2  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  24.4 
 
 		 868 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 472 aa  92.8  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1406 aa  92.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 863 aa  92  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  22.71 
 
 		 854 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 		 355 aa  89.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.59 
 
 		 767 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  39.68 
 
 		 1047 aa  89.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  23.75 
 
 		 657 aa  89.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.45 
 
 		 816 aa  87.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 1443 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.73 
 
 		 675 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  41.71 
 
 		 1096 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  29.33 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.08 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  42.94 
 
 		 974 aa  84.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 426 aa  83.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  24.8 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  37.77 
 
 		 1141 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>