207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1799 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  44.31 
 
 		 1219 aa  791    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  79.47 
 
 		 827 aa  1290    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1096 aa  2166    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  54.96 
 
 		 694 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  49.66 
 
 		 499 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  45.44 
 
 		 675 aa  324  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  36.99 
 
 		 1047 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  56.27 
 
 		 482 aa  289  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  40.48 
 
 		 1141 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  36.83 
 
 		 696 aa  244  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  37.92 
 
 		 1152 aa  179  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  38.66 
 
 		 916 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.28 
 
 		 587 aa  154  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  44.15 
 
 		 606 aa  148  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  47.37 
 
 		 343 aa  146  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.65 
 
 		 587 aa  142  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  35.28 
 
 		 549 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.2 
 
 		 12684 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  28.64 
 
 		 744 aa  137  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  33.53 
 
 		 777 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.51 
 
 		 626 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  42.93 
 
 		 606 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.15 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1406 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  31.1 
 
 		 1285 aa  132  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  34.77 
 
 		 1439 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.09 
 
 		 1143 aa  128  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.67 
 
 		 14944 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.28 
 
 		 612 aa  127  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.84 
 
 		 6885 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.98 
 
 		 1332 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  31.44 
 
 		 1146 aa  118  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  28.02 
 
 		 3516 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.25 
 
 		 846 aa  109  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  32.79 
 
 		 895 aa  108  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.87 
 
 		 5743 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  34.87 
 
 		 1496 aa  106  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.51 
 
 		 3586 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.05 
 
 		 3562 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  56.38 
 
 		 491 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  23.31 
 
 		 1554 aa  99  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26.79 
 
 		 848 aa  97.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.29 
 
 		 3721 aa  95.9  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.1 
 
 		 3824 aa  96.3  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  30.02 
 
 		 3824 aa  95.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.67 
 
 		 3824 aa  94.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.08 
 
 		 3739 aa  94.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.14 
 
 		 3325 aa  93.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1452 aa  92.8  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1457 aa  92.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.38 
 
 		 1951 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.11 
 
 		 4761 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.94 
 
 		 4106 aa  91.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  30.38 
 
 		 2178 aa  91.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.61 
 
 		 846 aa  89.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  41.18 
 
 		 1053 aa  88.2  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  34.93 
 
 		 1127 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  33.63 
 
 		 771 aa  88.2  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  34.44 
 
 		 1127 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  38.5 
 
 		 1054 aa  85.5  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  39.29 
 
 		 1051 aa  84  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  26.82 
 
 		 1887 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  27.43 
 
 		 846 aa  83.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 1127 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  39.13 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 2704 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  24.17 
 
 		 14609 aa  81.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  39.29 
 
 		 2002 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1538 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 1127 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  44.79 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 1129 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 1529 aa  75.5  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.02 
 
 		 1059 aa  74.7  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.25 
 
 		 2192 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  45.32 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  26.61 
 
 		 962 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  36.68 
 
 		 1123 aa  72.4  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28 
 
 		 4689 aa  72.4  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.74 
 
 		 1362 aa  71.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1537 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.98 
 
 		 2927 aa  71.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.48 
 
 		 1919 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.14 
 
 		 692 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 1224 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.11 
 
 		 703 aa  67.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.05 
 
 		 2117 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  33.47 
 
 		 739 aa  67  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.14 
 
 		 767 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  28.87 
 
 		 1424 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  22.17 
 
 		 1224 aa  66.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  33.53 
 
 		 1031 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.99 
 
 		 5561 aa  64.7  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1278 aa  64.7  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.55 
 
 		 831 aa  64.7  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  24.44 
 
 		 5561 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.34 
 
 		 5216 aa  63.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.09 
 
 		 3552 aa  63.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 		 899 aa  62.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>