31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2709 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  100 
 
 		 1554 aa  3142    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  23.75 
 
 		 1219 aa  91.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  22.93 
 
 		 1096 aa  90.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.4 
 
 		 1047 aa  83.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  22.2 
 
 		 1332 aa  72.4  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  23.55 
 
 		 2552 aa  66.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  24.48 
 
 		 1141 aa  65.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 		 587 aa  64.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  22.66 
 
 		 499 aa  64.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  21.5 
 
 		 675 aa  62.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  24.78 
 
 		 482 aa  62  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  20.2 
 
 		 1951 aa  55.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  22.08 
 
 		 3734 aa  53.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  26.29 
 
 		 827 aa  52.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  21.65 
 
 		 3736 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  22.06 
 
 		 5743 aa  51.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.74 
 
 		 1143 aa  50.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  23.01 
 
 		 899 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  39.74 
 
 		 1224 aa  49.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  22.45 
 
 		 3586 aa  48.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  22.89 
 
 		 3325 aa  48.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1804 aa  48.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.23 
 
 		 1695 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.33 
 
 		 1152 aa  48.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.71 
 
 		 491 aa  48.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0163  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1056 aa  47  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000567499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1457 aa  46.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  21.35 
 
 		 4106 aa  46.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  23.44 
 
 		 14944 aa  45.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  23.03 
 
 		 696 aa  45.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.7 
 
 		 587 aa  45.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>